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在这里,我们提出了一种独特的、可 3D 打印的大鼠植入物,名为 TD Drive,能够进行对称的双侧线电极记录,目前同时在多达 10 个分布式大脑区域进行记录。
多个大脑区域之间错综复杂的相互作用是大脑的大多数功能的基础。学习过程以及记忆的形成和巩固是两个严重依赖大脑功能连接的例子。此外,研究半球的相似性和/或差异性与这些多区域交互密切相关。因此,试图进一步阐明这些复杂过程的电生理学研究依赖于同时且通常以双侧方式记录多个位置的大脑活动。这里展示的是一种名为 TD Drive 的大鼠 3D 打印植入物,能够对称地进行双侧线电极记录,目前同时在多达十个分布式大脑区域进行记录。开源设计采用参数化设计原则创建,允许潜在用户通过简单地调整高级参数(例如记录电极位置的前后和内外侧坐标)轻松使驱动器设计适应他们的需求。植入物设计在 n = 20 只执行不同任务的 Lister Hooded 大鼠中进行了验证。该植入物与联机睡眠记录和旷场记录(对象探索)以及使用两种不同的商业记录系统和头部在大型迷宫中进行无线记录兼容。因此,这里介绍的是新型电生理植入物的适应性设计和组装,有助于快速准备和植入。
觉醒和睡眠期间大脑交互的多区域性质使得很难详尽地研究正在进行的生理过程。虽然功能性 MRI (fMRI) 和功能超声 (fUS) 等方法允许从全脑中采样大脑活动 1,2,但它们利用神经血管耦合从血流动力学活动推断大脑活动,从而限制了它们的时间分辨率2。此外,功能磁共振成像 (fMRI) 要求将研究对象放置在 MRI 扫描仪中,禁止对自由移动的动物进行实验。使用单光子或多光子成像对钙动力学进行光学成像,可同时对数百个神经元进行细胞类型特异性记录3。然而,头戴式显微镜(如 Miniscope3)确实允许自由移动,通常仅限于对完整大脑的浅表皮层区域进行成像4。虽然它们在皮层上的视场直径可能在 1 mm 左右,但这些头戴式显微镜的空间要求使其难以瞄准多个区域,尤其是相邻区域。因此,为了准确捕捉清醒和睡眠中的多区域大脑动力学,用植入感兴趣大脑区域的电极记录的细胞外电生理学是首选方法之一,因为它具有高时间分辨率和空间精度5。此外,它允许表征与从人类脑电图获得的分析相符的动物睡眠动力学,从而提高该方法的转化价值6。
传统上,使用细胞外电极记录大脑活动的研究采用单独的电极丝或电极束,例如四极管7。最先进的探针(如 Neuropixels 探针8 )允许同时靶向多个区域,因为它们在一个轴上对齐,允许沿该轴植入探针而不会损害动物。然而,准确同时记录多个空间分离的区域仍然具有挑战性,现有方法要么成本高昂,要么耗时。
近年来,立体光固化成型等增材制造方法已得到广泛应用。这使得研究人员能够开发出适应其实验要求的新型电极植入物9,例如,简化多个大脑区域的可重复靶向。通常,这些植入物设计也作为开源硬件与学术界共享,允许其他研究人员根据自己的目的进行调整。特定植入物的适应性程度因植入物的设计方式和共享方式而异。参数化建模10 是计算机辅助设计中的一种常用方法,其中设计的不同组件通过相互依赖的参数和定义的设计历史链接在一起。实施参数化方法来设计植入物可以提高其可重用性和适应性10,因为更改单个参数会自动更新完整的设计,而无需对设计进行复杂的重新建模。因此,设计本身必须以可编辑的格式共享,从而保留参数关系和设计历史。仅表示几何基元的文件格式 (如 STL 或 STEP) 会使已发布模型的后续参数化修改不可行。
虽然四极管超驱动器 11,12,13 可以记录数十个四极管,但它们的组装和植入是耗时的,而且它们的质量在很大程度上取决于研究人员个人的技能和经验。此外,它们通常将引导记录电极到目标位置的导管组合成一个或两个较大的束,从而限制了可以有效靶向的区域的数量和分布。
其他植入物14,15 暴露了完整的颅骨,并允许自由放置多个携带记录电极的单独微型驱动器。虽然在手术期间放置独立的微型驱动器16 最大限度地提高了灵活性,但它会增加手术时间,并且由于单个微型驱动器的空间要求,很难针对多个相邻区域。此外,虽然植入物是开源的,但它们仅作为 STL 文件发布,因此修改很困难。
具有更固有参数化理念的驱动器的一个例子是 RatHat17。通过提供覆盖整个颅骨背表面的手术模板,它可以精确定位多个大脑目标,而无需在手术过程中使用立体定向框架。套管、optrodes 或 tetrodes 有多种植入物变体可供选择。然而,虽然该驱动器可以免费用于学术目的,但它并不是开源发布的,这给研究人员评估和使用植入物带来了障碍。
本文介绍了 TD Drive(见 图 1),这是一种用于大鼠细胞外电极记录的新型 3D 打印植入物。TD Drive 旨在克服现有解决方案的一些缺点:它允许同时使用独立的电极线针对多个大脑区域,镜像到两个半球。由于其设计简单,经验不足的研究人员可以在几个小时内以相对较低的成本组装。TD Drive 以开源形式发布,采用易于修改的文件格式,使研究人员能够根据自己的特定需求进行调整。从 TD Drive 的设计过程开始就采用参数化 3D 建模方法,可以将必要的参数更改抽象出来:要更改目标位置,研究人员只需编辑代表其背腹和前后坐标的参数,而无需重新设计驱动器本身。修改和制造 TD Drive 的文件可以在 https://github.com/3Dneuro/TD_Drive 中找到。
图 1:TD Drive 概述。 (A) 带保护盖的 TD Drive 的效果图。(B) 显示内部零件的渲染。TD Drive 具有 (a) 多个参数可调的记录位置,用于固定和可移动的电极线,一个带有 (b) 与常见系留和无线数据采集系统兼容的高密度 Omnetics 连接器的 EIB,以及 (c) 针对 Intan/Open Ephys 系统的记录优化的直观通道映射(参见 补充图 1)和 (d) 一个盖子,用于在联机录音和未连接 Headstage 时保护植入物。(C) TD Drive 底部的导向模板有助于放置导向插管,并作为手术过程中植入物位置的冗余验证。 请单击此处查看此图的较大版本。
植入物设计在 n = 4 中进行了试点,在 n = 8 中进行了验证,并在执行不同任务的 n= 8 只 Lister Hooded 大鼠中得到确认。前 4 只动物用于开发驱动器和调整参数。然后,对 8 只动物进行了完整的试点(如结果所示)。运行了第二组 8 只动物,并将其纳入植入物存活分析。该植入物与联机睡眠记录和旷场记录(对象探索)以及使用两种不同的商业记录系统和头部在大型迷宫(HexMaze 9 m x 5 m)中的无线记录兼容。这两组 8 人使用两种不同的采集系统进行记录 - 联机用于更长的睡眠记录和无线用于大型迷宫探索记录。我们可以得出结论,这种简单的线驱动允许经验不足的研究人员对更大的队列进行长时间的实验,以实现睡眠阶段分析以及多个大脑区域的振荡分析。这与迄今为止的大多数电生理植入物形成鲜明对比,由于难度和时间强度,允许较小的动物队列,并且通常需要非常有经验的实验者。然而,通过这种驱动器,无法记录单个神经元的活动;因此,其用途仅限于研究局部场电位 (LFP) 和求和活动。
这项研究得到了荷兰中央委员会Dierproeven(CCD)的批准,并根据《动物实验法》(协议代码:2020-0020-006和2020-0020-010)进行。使用到达时 9-12 周龄的雄性 Lister Hooded 大鼠。实验方案中使用的试剂和设备列在 材料表中。有关驱动器构建过程的步骤,请参见 补充图 1 和 补充图 2 。
1. 调整和创建 3D 模型和电极接口板 (EIB) 数据
2. 打印 3D 模型并制造 EIB
注意:在本研究中,使用市售的 3D 打印机来生产部件(参见 材料表)。当使用不同的打印机或外包生产时,可能需要使用不同的、类似的树脂来生产零件。
3. 3D 打印体的后处理
注意:瓶盖和梭子不需要后处理。根据 3D 打印件的质量,它们可能需要轻轻打磨或去除残留的支撑痕迹。打磨和钻孔时,注意不要打破驱动体的壁。如有必要,用异丙醇和软布和/或压缩空气清洁后处理部件。
图 2:TD 驱动器的渲染图。 (A,B) 大鼠头骨模型上的 TD 驱动器 (A) 没有和 (B) 带保护帽。(C) 聚酰亚胺导管正确插入六个记录位点中的每一个。(D) 一个孤立的、完整的穿梭组件,具有导向螺钉、3D 打印穿梭和焊接黄铜嵌件。(E) 插入两个滑块的 TD Drive 体。用红色标记:(a) 穿梭车的埋头孔,(b) 穿梭导轨,(c) 驱动体的中心基座,(d) 导轨模板。(F,G)驱动器主体顶部 (F) 和底部 (G) 上可能需要在 3D 打印后进行后处理的重要位置分别用红色箭头表示。 请单击此处查看此图的较大版本。
4. 穿梭车组件
5. 组装驱动器
6. 准备保护罩
7. 准备电极丝
8. 准备地线和脑电线
9. 将线束装入驱动器
10. 驱动种植手术
注意:此步骤简要概述了植入 TD Drive 的外科手术程序。更广泛的植入方案,包括工具描述以及药物的剂量和浓度,可以在 补充文件 1 中找到。
11. EIB 恢复
使用协议中提供的说明,多个实验人员可以轻松构建 TD Drive。在驱动开发 (n = 4) 之后,对 8 只动物进行了一次完整的试验。另外一批 8 只动物被植入,并进行了实验数据收集。由于尚未完成对这些动物的数据分析,因此它们已被纳入生存分析,但未包含在其他分析(例如,靶向或组织学)中。到达后 2 周进行种植手术(参见 图 3A 了解试点中使用的目标位置)。植入物采用常规外科手术进行,持续 ~3 小时。一位经验丰富的外科医生进行了初始植入,可以教有经验的和新手的实验者进行 2-3 次手术。
图 3:种植手术、睡眠数据和宽带活动。 (A) 示意图概述,显示开颅手术(蓝色圆圈)和颅骨螺钉(绿色:EEG,蓝色:GND,灰色:锚固螺钉,请注意两个锚固螺钉位于颅骨侧面)。(B) 在睡眠和清醒期间头部被拴住的植入动物的照片。(C) 来自拴系动物 PFC (Prelimbic) 和 HPC (Ca1) 的示例睡眠数据,分为具有 theta 的 REM 睡眠和具有 delta、纺锤体和波纹的非 REM 睡眠。Y 轴:微伏,X 轴:秒。例如,这些数据可用于睡眠评分或振荡事件检测和分析 (D) 在清醒的动物中无线记录的宽带活动示例(左侧的嘈杂通道未连接)。 请单击此处查看此图的较大版本。
图 4:植入物的耐用性、delta 检测和组织学。 (A) 两轮长时间实验的植入物存活图。值得注意的是,在第 85 天,n = 8 完成了实验并计划灌注。(B) 稳定性的数据示例。显示的是记录日(每周 ~3 天)海马通道中 delta 检测的计数。每只动物都表现出正常的变化,具体取决于睡眠量,但信号和检测没有随时间推移的一般漂移。(C) 代表性组织学显示一只大鼠的双侧靶向。左列:左半球,右列:右半球。AP 坐标表示所描绘切片的前后坐标,箭头指向目标区域的病变。放大倍率:1.6 倍。 请单击此处查看此图的较大版本。
所有动物都恢复良好并耐受植入物(图 3B)。额叶和脾后电极是固定的,但海马束是可移动的。海马束植入背腹深度 2 mm,并在手术恢复 2 周期间进行调整以最大限度地提高 HPC 覆盖率,在睡眠习惯期间实时检查信号。在 8 只动物中的 7 只中,所有目标部位都至少在一个半球上到达(命中率表 2 ,代表性组织学见 图 4C )。在记录盒中成功进行唤醒和睡眠记录,并在更大的迷宫中进行无线记录(示例数据 图 3C、D)。动物将植入物保留 2 个月,此时个体动物会开始丢失它们;然而,大多数动物将植入物保留到植入后第 85-100 天的实验结束(图 4A)。在此期间,LFP 保持稳定,从检测到 delta 振荡的示例分析中可以看出(图 4B)。随时间变化正常,但在任何记录的大脑区域(包括 CA1 的锥体层)中都没有信号的系统性漂移。建议在手术后 10-15 周内结束实验。所有 EIB 都可以恢复。
我们应用这种植入物主要用于测量睡眠阶段和睡眠振荡对学习和其他干预的反应。例如,口服 CBD 摄入量如何影响大脑区域的振荡发生和连贯性(参见 Samanta 等人20)。
参数 | 最小值 (mm) | 最大值 (mm) |
medioLateralSite1 | 0.75 | 2 |
medioLateralSite2 | 1.5 | 5 |
medioLateralSite3 | 0.75 | 2 |
表 1:对控制记录站点中外侧坐标的参数手动施加的限制概述。
半球 | PFC | RSC | CA1 pyr. |
右 | 8 页,共 8 | 5 页,共 8 | 6 页,共 8 页 |
左 | 8 页,共 8 | 7 页,共 8 | 7 页,共 8 |
表 2:8 只动物的飞行员的命中率。 在 8 只动物中有 4 只中,所有电极都放置正确。然而,在 8 只动物中的 7 只中,所有大脑区域都正确地靶向了至少一个半球(除了 1 只大鼠缺少 CA1 锥体层)。
补充图 1:TD Drive 架构。 (页首)TD Drive 与 Intan RHD32 头级一起使用时的通道映射概述。(下)线束配置的附加图示。请点击此处下载此文件。
补充图 2:TD Drive 在构建过程的几个阶段的其他图片。请点击此处下载此文件。
补充文件 1:植入 TD Drive 的示例协议。 程序和目标位置根据作者的研究问题和机构政策进行调整。请点击此处下载此文件。
本文介绍了一种适应性强的植入物,用于自由移动大鼠的双侧、对称多区域焊丝电极记录。
通过更改预定义参数轻松调整植入物的能力是创建 TD Drive 的动机之一。虽然旨在最大限度地提高参数变化的灵活性,但它们之间关系的固有约束必然会限制这种适应性。默认情况下,前后参数没有设置任何限制,这些坐标由逻辑站点间交互和驱动器主体的整体大小控制。控制所有记录站点的中外侧坐标的参数受手动施加的限制(见 表 1)。许多参数化选项的基础是设计特征之间的许多交互。在某些情况下,这些交互可能会变得不相交。在理想情况下,参数值的所有可能组合都是有效的。然而,由于 TD Drive 的设计更加复杂,它选择将中外侧坐标限制在测试范围内。原则上,可以选择测试限制之外的坐标。但是,不建议进行此类更改,因为设计的完整性可能会受到影响,并且在保持超限坐标的同时恢复设计可能需要 CAD 建模经验。这是驱动器生产的便利性和灵活性之间权衡的固有结果 - 更大的自由度确实会使驱动器的参数定义更加复杂,并可能导致过于精细的意外结果(例如,需要为驱动器设计的微小更改生成不同的 EIB)。
在 TD Drive 的这种表现形式中所做的参数选择是由当前实验者的偏好指导的。例如,它选择增加 TD Drive 基座的高度,以提高手术过程中植入的便利性,但最终植入物的成本略高。然而,该植入物仍然比具有可单独移动四极管的驱动器小得多,并且被动物广泛接受。用于固定驱动器的两个基座( 图 2E 中的“c”)被故意放置在中心平面上,平行于大鼠头骨的中线缝合线。这将记录位置限制为 0.75 mm >内侧坐标。通常,中线以下矢状窦的存在在解剖学上对开颅手术施加了类似的限制。TD Drive 的当前设计是在 Autodesk Fusion 中创建的。虽然它是最先进的参数化 3D 计算机辅助设计程序之一,并且在发布时确实提供了用于学术用途的免费许可证,但该程序的商业和基于云的性质确实对设计的免费可用性构成了风险。因此,将设计移植到真正的开源参数化CAD软件21(例如FreeCAD)对于将来的迭代可能是必要的。
TD Drive 的手术可以在 2-3 小时内进行。导线的目标位置以立体定向方式标记(PFC +3.5AP 靠近中线,HPC -3.8AP -/+ 2.5 ML,RSC -5.8 靠近中线),并且螺钉电极、GND 和额外的颅骨螺钉用于稳定性相对于这些位置放置。虽然 TD Drive 模板确实提供了立体定向位置,但聚酰亚胺管放置的不精确性和使用不太硬的管材可能会导致电极位置的微小变化。因此,建议钻小开颅手术(而不是导管大小的 0.5 mm 钻孔)以解决这种可变性。在这种手术中,针对 RSC 和 HPC 靶区钻一个更大的开颅手术。对于 PFC 和 RSC,选择在固定深度植入线束。PFC 束具有针对两个不同深度的导线,用于记录前边缘和前扣带皮层。HPC 束是可移动的,并由 3 根不同高度的电线构成,以方便到达 Ca1 金字塔层和放射层。最后一条较短的电线允许从 PPC 进行记录。在手术期间将最长的电极丝移动到目标深度(距脑表面腹侧 2 mm)时,我们获得了靶向海马 Ca1 的最佳结果,在手术后两周内在实时信号检查期间仅进行了小幅调整,以适应个体差异和手术后的脑肿胀。
大鼠大型植入物(例如四极管超速驱动器)的一个问题是植入物稳定性降低和动物丢失植入物的可能性。对于 TD Drive,由于 2 个月后植入物稳定性下降(16 只动物中有 3 只)观察到个体故障。因此,建议将 TD Drive 用于预期最长持续时间为 8 周的实验。我们表明,在这个时间段内,信号是稳定的 - 即使是精确的海马锥体层记录 - 并且没有系统性的漂移或显着的摆动影响 LFP 记录。实现这种长期稳定性的一个因素是使用多个颅骨螺钉(见 图 3A)。在某些情况下,使用过的颅骨锚固螺钉的数量会增加感染的风险22。然而,这可能最与头部固定大鼠有关,其中头部固定在头板和连接的锚固螺钉上的重复应力会导致植入物降解,从而促进感染。另一个增加植入物失败风险(并可能引起行为动物不适)的因素是植入物的重量。一个完整的 TD 驱动植入物带有锚固螺钉和牙科粘固剂,重约 7 克,其中 3D 打印部件和 EIB 约占重量的一半。由于 TD 驱动器的重量很轻(不到其他大型四极管超驱动器的 1/3),因此植入物重量过重不太可能成为 TD 驱动器故障的重要因素。一般来说,稳定、无感染的种植体的主要因素是无菌手术程序和将种植体涂在种植体上的牙科粘接剂、锚固螺钉和颅骨23 的良好附着力。我们只评估了 TD Drive 记录局部场电位的情况,并没有尝试获取单个单位的活动。虽然我们预计植入物通常足够稳定以做到这一点,但在会话内和会话之间遵循相同的单元可能需要优化穿梭的稳定性,例如,通过优化穿梭导轨( 图 2E 中的“b”)。在其他记录站点增加可移动穿梭车将允许额外使用可移动的导线电极,这是确保在单元记录中获得更好的长期信号质量的首选方法。
TD Drive 的总组装时间约为 3 小时,手术时间约为 2-3 小时,在四极管 hyperdrive 和更简单、不可调节的多线植入物之间提供了折衷方案24。通过选择的目标,实现了来自 10 个大脑区域的 6 束的记录。与其他用于不可移动线束的植入物相比,记录位点的对称放置产生了另一个优势:如果偏侧化无关,同时在两个半球植入导线会使击中正确目标的机会增加一倍,并且每只动物的数据产量会增加一倍。在试点中,8 只动物中有 4 只正确地瞄准了所有 5 个目标部位(PFC 包括前边缘 (PRL) 和前扣带回 (ACC) 皮层、RSC、PPC 和 HPC 的 Ca1 锥体层),但 8 只动物中有 7 只至少记录了一侧的每个大脑区域。因此,对于那些想要快速简便地构建解决方案来记录 LFP 的人来说,这种驱动器是可取的,这些解决方案可以由经验不足的研究人员应用,尤其是当需要更多的动物时,例如在睡眠研究中。由于有许多高端四极管超驱动器可以记录单个神经元的活动,即使是非常熟练和经验丰富的研究人员每年也只能构建和植入 2-6 个植入物,其中许多无法成功到达任何感兴趣的大脑区域。需要多年的训练才能达到更高的成功率,即便如此,可以有效记录的动物数量仍然很低。
总之,TD Drive 提供了一种简单且快速构建的线驱动器,具有 6 个线束,可以轻松适应包含不同的记录位点和其他植入物,例如插管和纤维。
TS 和 PvH 是荷兰奈梅亨 3Dneuro 的员工。3Dneuro 共同开发并生产 TD Drive。
作者要感谢 Angela Gomez Fonseca 为开发该驱动器提供的灵感,以及所有用动物进行试点实验的学生 Milan Bogers、Floor van Ravenswoud 和 Eva Severijnen。这项工作得到了荷兰研究委员会 (NWO;分频节目 17619 “INTENSE”)。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
0.5 mm drill bit | McMaster | 2951A38 | |
1.27 mm pitch interconnected SIP/DIP socket (Mill-Max) | Mouser Electronic | 575-003101 | For essembling and connection of EEG & GND screws |
5 minute epoxy | Bison | Commercially available | regular off-the-shelf epoxy |
cyanoacrylate glue | Loctite | Super Glue-3 | |
EEG wire | Science Products GmbH | 7SS-2T | |
Electrode wire | Science Products GmbH | NC7620F | |
Ethanol | LC | For standard pre-operative sterilization procedure of drive | |
Fine forceps (5) | FST | 91150-20 | For wire bundle preperation and handling |
Form 3B | Formlabs | 3D printer used to 3D print the self-printed parts of the TD drive | |
Gold pins (small) | Neuralynx, Inc. | 9885 | Attachment of electorde wires to EIB board |
Ground wire | Science Products GmbH | SS-3T/A | |
High-density connector | LabMaker GmbH/Omnetics | A79026-001 | |
Lister Hodded rats | Charles River Laboratories | Crl:LIS | we used male rats, 9-12 weeks of age at arrival |
M1 brass insert | AliExpress | Commercially available | https://aliexpress.com/item/33047616164.html |
M1 tap | McMaster | 2504A33 | |
M1x16 screw | Bossard | 1096613 | |
M1x3 stainless steel screws | Screws and More | 84213_14985 | |
M2.5x5 polyimide screws | Screws and more | 7985PA25S_50 | |
mineral oil | McMaster | 1244K14 | |
Nail polish | Etos | Commercially available | For color coding EEG and GND wires |
painter's tape | Gamma | Commercially available | For wire bundle preperation |
Pin vise | McMaster | 8455A16 | |
plotting paper | Canson | Commercially available | For wire bundle preperation |
polyimide tubes | Amazon / Small Parts | TWPT-0159-30-50 | AWG, 0.0159" ID, 0.0219" OD, 0.0030" Wall, 30" Length |
RHD 32-channel headstage with accelerometer | Intan Technologies, LLC | C3324 | For tethered recordings in the sleepbox |
RHD 3-ft (0.9 m) standard SPI cables | Intan Technologies, LLC | C3203 | From commutator to headstage |
RHD 6-ft (1.8 m) standard SPI cables | Intan Technologies, LLC | C3206 | From OpenEphys box to commutator |
Slip Ring with Flange | Adafruit | 1196 | Commutator: 22 mm diameter, 12 wires |
Solder flux | Griffon S-39 50 ml | Commercially available | For soldering EEG & GND screws |
soldering paste | Amazon | B08CBZ5HC5 | |
stainless steel M2 nut | McMaster | 93935A305 | |
Tethered recording setup | OpenEphys | Acquasition Board | |
Wireless recording logger | SpikeGadgets | miniLogger 32 | For wireless recordings in the task |
Wireless recording setup | SpikeGadgets | Main Control Unit (MCU) incl. breakout board and RF transceiver | For wireless recordings in the task |
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