Protokolümüz, endokrin bozucu kimyasalların kısa vadeli yan etkilerinin hızlı bir şekilde hesaplanmasını sağlamak için son derece erişilebilir ve açık bir yazılım programı kullansın. Bu OECD QSAR Toolbox kimyasal maddelerin toksisitesini tahmin etmek için yararlıdır ve endokrin bozucuların akut ekotoksisitesini kullanıcı dostu bir şekilde değerlendirmek için etkili bir yöntem sağlar. QSAR Araç Kutusu'nu çalıştıran kullanıcı varsayılan olarak Giriş Araç Kutusu aşamasında başlar ve Araç Kutusu otomatik olarak Belge 1 adlı bir çalışma dosyası oluşturur.
Kimyasal Soyut Hizmet Numarasını tıklattıktan sonra, kullanılabilir metin alanına hedef maddenin kimyasal soyut hizmet numarasını girin ve Ara'yı tıklatın. Yapı düğmesi ile, madde basitleştirilmiş moleküler giriş hattı giriş sistemi kodu ile de aranabilir. Birden çok hedef madde için in-silico test gerçekleştirmek için, her kimyasal soyut hizmet numarası tek bir satırda listelenen bir metin editörü basit bir madde listesi yazın ve uygun bir adla metin dosyası kaydedin.
Ardından, Veriler'i tıklatın ve Ekotoksikolojik Bilgiler altında listelenen veritabanlarının denetlenir olduğunu onaylayın. Seçili ayarları kabul etmek için Giriş'i tıklatın, Sorgula'yı seçin ve iletişim penceresinde Evet'i tıklatın. Kimyasal Soyut Hizmet sekmesinin altında, metin dosyası olarak kaydedilen madde listesini yüklemek için Yük Listesi'ni seçin.
Açılan menünün altındaki Ekle'yi tıklatın ve Yürüt'ü tıklatın. QSAR Araç Kutusu, arama için alınan maddelerin sayısını belirten bir ileti görüntüler. Profil oluşturma için Profil Oluşturma Araç Kutusu sahne düğmesine tıklayın ve sahne seçeneği panelinde Profil Oluşturma Yöntemleri'ne gidin.
Profil Oluşturma Yöntemleri penceresinde Tümünü Seç'i tıklatın ve Endpoint Specific altında sutoksisitesi ile ilgili Önceden Tanımlanmış ve profilcilerin tümünün kontrol edildiğini onaylayın, ardından Uygula'yı tıklatın, tümleşik 2D ve 3D QSAR modellerini istediğiniz gibi çalıştırmak için Parametreleri sağ tıklatın. Veri toplama için Veri Araç Kutusu aşaması düğmesini tıklatın ve eylemler araç çubuğunda Topla'yı tıklatın. Tüm deneysel verileri toplamak için Tüm Uç Noktaları'nı seçin veya bitiş noktasına özgü deneysel verileri toplamak için Seç'i seçin'i seçin.
İlginin bitiş noktasını sağ tıklatın ve Tamam'ı tıklatmadan önce kullanılabilir terimleri ve okları kullanarak bitiş noktası ağacını tercih edilen şekilde düzenleyin. Ardından ilginin bitiş noktasını sağ tıklatın ve toplanan verileri elektronik tabloya aktarmak için Veri Matrisi'ni dışa aktar'ı seçin. Dışa aktarma listesine diğer uç noktaların eklenmesini sağlayan bir matris dışa aktarma sihirbazı görüntülenir.
Seçimi bitirin ve dosyayı kaydetmek için Dışa Aktar'ı tıklatın. Veri boşluğu doldurma için Veri Boşluğu Doldurma Araç Kutusu aşaması düğmesini tıklatın ve Otomatik'i tıklatın. 96 saat içinde %50 oranında ölümcül konsantrasyon olan Ekotoksikolojik Bilgi ve Balık'ı seçin ve Tamam'ı tıklatın.
İş akışı denetleyici penceresi görüntülenir. Toplu Iş modunu çalıştırıyorsanız, iş akışını yürütmek için üzerinde bulunan maddelerin aralığını belirtin. Tahmin başarıyla yürütüldüyse, Araç Kutusu Nu Bildir düğmesini tıklatın, elde edilen tahmin değerini sol tıklatın, Tahmin'i tıklatın ve açılır penceredeki rapor içeriğini ve görünümünü özelleştirin.
İleri'yi tıklattıktan sonra Rapor Oluştur'u tıklatın ve tahmin ve kategori raporlarını PDF dosyaları ve veri matrisini elektronik tablo dosyası olarak kaydedin. Seçilen endokrin bozucuların öngörülen akut toksisitelerinin bu nicel analizinde, öngörülen veri noktaları nın bir günlük kütüğü ölçeği olarak deneysel veri noktalarına karşı çizildiğinde, analiz edilen tüm balıklar ve temsili türlerimiz için her iki parametre arasında pozitif bir korelasyon bulunmuştur. En yüksek güvenilirliğin güvenlik değerlendirmesini sağlamak için, öldürücü konsantrasyonun %95 güven aralığının öngörülen alt limitinin öngörülen alt sınırının deneysel olarak elde edilen değerlere karşı %50'si çizilerek daha fazla hesaplamaanalizi yapılmıştır.
Yüksek güvenlik eşiği olan bu değerlendirmede, deneysel olarak elde edilen değerlere kıyasla toplam test edilen endokrin bozan bileşiklerin %92'sinin koruyucu menzile düştüğü gösterilmiştir. Burada östrojen reseptör bağlayıcıları için% 50 değerleri tahmin öldürücü konsantrasyon ortalama düzeyleri olmayan bağlayıcılar daha yüksekti. Buna karşılık, 50% değerleri deneysel öldürücü konsantrasyon için, olmayan ve zayıf bağlayıcılar üç düzeyde güçlü östrojen reseptör bağlayıcıları daha yüksekti.
Bu yordam yalnızca benzersiz bir tanımlayıcısı olan kimyasal maddelere uygulanabilir ve bu durumda SMILES kodudur. OECD QSAR Araç Kutusu'nda entegre edilmiş ve benzer şekilde uygulanabilen ve cilt hassasiyeti için bir otomatik iş akışı daha vardır.
