Скрининг модификации гистонов с использованием жидкостной хроматографии, спектрометрии подвижности захваченных ионов и времяпролетной масс-спектрометрии

Предложен метод с использованием протокола экстракции гистонов с эффективностью 95%. Вместе с LC-TIMS-ToF MS/MS можно за короткое время получить скрининг для тех ПТМ, которые присутствуют в гистоне. И, прежде всего, возможность разделения изомеров.

Разделение изомерных пептидов, хотя и возможно только с помощью тандемной масс-спектрометрии, часто затруднено. Используя TIMS, мы вводим дополнительное измерение разделения, упрощая идентификацию многих позиционных изомеров. Кроме того, пассивная технология повышает чувствительность этих экспериментов, что еще больше улучшает наши возможности по анализу эпигенетических вариаций.

С повышением способности идентифицировать позиции ПТМ появляется возможность дальнейшего определения корреляции между различными факторами окружающей среды или биологическими факторами и их влиянием на эпигеном. Методы, улучшающие и облегчающие анализ гистонов, могут быть применены в нескольких областях исследований, включая медицинскую химию и химию окружающей среды. Динамика подтверждения белка в нативном или поврежденном состояниях будет установлена при внедрении TIMS MS/MS с HDX.

С помощью LC-TIMS-ToF MS/MS и Nano LC-TIMS-ToF MS/MS будут отображены различия в PTM, существующие в различных биологических образцах.