Method Article
Este protocolo descreve como estabelecer, manter, modificar geneticamente, diferenciar, caracterizar funcionalmente e transplantar organoides da glândula lacrimal derivados de tecido primário de camundongo e humano.
A glândula lacrimal é um órgão essencial para a homeostase da superfície ocular. Ao produzir a parte aquosa do filme lacrimal, protege o olho do estresse de dessecação e insultos externos. Pouco se sabe sobre a (pato)fisiologia das glândulas lacrimais devido à falta de modelos in vitro adequados. A tecnologia organoide provou ser uma plataforma experimental útil para múltiplos órgãos. Aqui, compartilhamos um protocolo para estabelecer e manter organoides de glândulas lacrimais de camundongos e humanos a partir de biópsias de glândulas lacrimais. Ao modificar as condições de cultura, aumentamos a funcionalidade organoide da glândula lacrimal. A funcionalidade organoide pode ser investigada através de um ensaio de "choro", que envolve a exposição dos organoides da glândula lacrimal a neurotransmissores selecionados para desencadear a liberação de lágrimas em seu lúmen. Explicamos como imaginar e quantificar esse fenômeno. Para investigar o papel de genes de interesse na homeostase da glândula lacrimal, estes podem ser geneticamente modificados. Descrevemos detalhadamente como modificar geneticamente organoides da glândula lacrimal usando editores de base - desde o design de RNA guia até a genotipagem de clones organoides. Por fim, mostramos como sondar o potencial regenerativo de organoides da glândula lacrimal humana por implante ortotópico em camundongos. Juntos, este conjunto de ferramentas abrangente fornece recursos para usar organoides da glândula lacrimal humana e de camundongos para estudar a (pato)fisiologia da glândula lacrimal.
A glândula lacrimal é o epitélio glandular responsável pela produção da maior parte da camada aquosa do filme lacrimal1. A camada aquosa do filme lacrimal não contém apenas água para lubrificar a superfície ocular, mas também um grande repertório de componentes antimicrobianos que protegem a superfície ocular deinfecções2. Quando a glândula lacrimal está danificada ou inflamada, ocorre a doença do olho seco, que resulta em desconforto para o paciente e pode, eventualmente, levar à perda da visão3. Ao longo dos anos, sistemas-modelo para estudar a glândula lacrimal, em particular a glândula humana, têm sido limitados 4,5,6. Isso tem contribuído para uma lacuna de conhecimento sobre a função da glândula lacrimal em condições fisiológicas e patológicas.
Recentemente, modelos in vitro têm sido desenvolvidos para estudar a glândula lacrimal em uma placa 7,8,9. Esses organoides da glândula lacrimal são derivados de células-tronco adultas cultivadas como estruturas tridimensionais em uma matriz extracelular suplementada com um coquetel de fatores de crescimento que sustenta suas capacidades regenerativas in vitro7. A vantagem dos organoides derivados de células-tronco adultas (ASC) é que eles podem ser mantidos por muito tempo enquanto recapitulam as características do tecido saudável. Esse tipo de organoide é composto exclusivamente por células epiteliais, ao contrário dos organoides derivados de células-tronco pluripotentes induzidas (iPSC), que também podem conter células estromais, por exemplo. Ao contrário dos organoides derivados de células-tronco pluripotentes (PSC), os organoides ASC são estabelecidos diretamente do tecido adulto e não requerem modificações genéticas para serem expandidos. Os organoides ASC expressam características do adulto10.
Este protocolo contém uma caixa de ferramentas para derivar organoides da glândula lacrimal do tecido primário humano e de camundongo. O protocolo descreve como melhorar ainda mais a funcionalidade dos organoides pela simples retirada do fator de crescimento e como provocar os organoides a secretar fluido lacrimal realizando um ensaio de inchaço. Este protocolo inclui adicionalmente um método de transfecção baseado em eletroporação para engenharia genética de organoides de camundongos usando editores de base derivados de CRISPR. Ao contrário do Cas9 convencional, o uso de editores de base permite a modificação de bases simples no genoma sem gerar uma quebra de fitadupla11,12. Finalmente, descreve-se o transplante ortotópico de organoides da glândula lacrimal humana em camundongos imunodeficientes e a subsequente avaliação histológica do enxerto. Esta ferramenta organoide da glândula lacrimal pode ser usada em pesquisas sobre regeneração e função da glândula lacrimal e para modelagem de doenças genéticas e inflamatórias.
Os experimentos com camundongos foram aprovados pelo Comitê de Ética Animal da Academia Real de Artes e Ciências dos Países Baixos (KNAW) sob a licença do projeto AVD8010020151. Os organoides foram derivados de material excedente de camundongos. As biópsias da glândula lacrimal humana foram coletadas do material residual de pacientes submetidos à cirurgia no University Medical Centre Utrecht (UMCU) após aprovação pelo comitê de ética médica sob o protocolo número 18-740. O protocolo contém várias seções que são descritas na Figura 1.
Figura 1: Visão geral do protocolo. Esta figura destaca as diferentes etapas do protocolo. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
NOTA: Todas as composições de meio e tampão estão descritas na Tabela Suplementar 1.
1. Estabelecimento de organoides de glândulas lacrimais humanas e de camundongos
2. Expansão dos organoides da glândula lacrimal humana e do camundongo
3. Criopreservação dos organoides da glândula lacrimal humana e de camundongos
4. Diferenciar organoides da glândula lacrimal e avaliar sua funcionalidade
5. Construindo um plasmídeo para nocautear Pax6
6. Geração de clones Pax6 KO
7. Transplante ortotópico de organoides da glândula lacrimal humana em camundongos NSG
Após a dissecção da glândula lacrimal de camundongos (Figura 2A), a digestão enzimática e mecânica gerou pequenos fragmentos de tecido, entre os quais foi possível distinguir os ácinos e ductos (Figura 2B). Os grandes pedaços de tecido remanescentes desestabilizariam a MEC, o que reduziria o crescimento organoide inicial. A derivação organoide da glândula lacrimal de camundongo foi bem sucedida quando organoides císticos de ~500 μm de diâmetro foram encontrados após ~7 dias, estágio em que os organoides estavam prontos para serem divididos (Figura 2C). Mesmo que a derivação organoide geral seja bem-sucedida, alguns organoides podem começar a crescer antes de parar eventualmente. Os organoides da glândula lacrimal humana cresceram como cistos dentro de 3-4 dias e atingiram o tamanho completo em 10-14 dias após o isolamento do tecido (Figura 2D). Tanto para camundongos quanto para humanos, a derivação organoide às vezes falhava, com nenhum ou poucos organoides crescendo; Isso foi geralmente causado pela digestão excessiva do tecido. Os organoides da glândula lacrimal de camundongo poderiam ser passados pelo menos 40x e os organoides humanos pelo menos 20x. A passagem foi feita a cada 7-10 dias, em média, dependendo do crescimento organoide.
Figura 2: Estabelecimento dos organoides das glândulas lacrimais de camundongos e humanos. (A) Fotografias dos diferentes estágios da dissecção da glândula lacrimal de camundongos. A seta aponta para a glândula lacrimal sob sua membrana protetora. (B) Imagens de campo claro de células da glândula lacrimal de camundongos logo após a digestão do tecido, com inserções mostrando um ácino e um ducto. (C) Imagens de campo brilhante de uma derivação organoide da glândula lacrimal de camundongo bem-sucedida e malsucedida. (D) Imagens de campo claro do crescimento organoide humano ao longo de 14 dias. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os organoides da glândula lacrimal contêm uma grande proporção de células-tronco quando cultivadas no meio de expansão. Para aumentar seu nível de diferenciação, montamos um camundongo e um meio de diferenciação humano com reduzido teor de fator de crescimento. Após 5 e 7 dias, respectivamente, no meio de diferenciação, os organoides das glândulas lacrimais de camundongo e humano tornaram-se mais densos (Figura 3A-B). Essa alteração morfológica correlacionou-se com o aumento das propriedades funcionais. A aplicação do ativador cíclico de AMP forskolina ou do neurotransmissor noradrenalina resultou em inchaço organoide (isto é, secreção de água apical) em menos de 3 h (Figura 3C). Quando o inchaço demorava mais de 3-4 h, isso sugeria que os organoides não eram suficientemente diferenciados e/ou não expressavam marcadores funcionais, como receptores para neurotransmissores.
Figura 3: Diferenciação dos organoides das glândulas lacrimais de camundongos e humanos e ensaio de inchamento funcional em organoides humanos. (A) Imagens de campo claro de organoides da glândula lacrimal de camundongos cultivados em meio de expansão por 7 dias e em meio de diferenciação por 5 dias após 2 dias em meio de expansão. (B) Imagens de campo claro de organoides da glândula lacrimal humana cultivados em meio de expansão por 11 dias e em meio de diferenciação por 9 dias após 2 dias em meio de expansão. (C) Imagens de campo claro de organoides diferenciados da glândula lacrimal humana expostos a meio de diferenciação fresco (controle), a forskolina a 1 μM e a noradrenalina a 100 μM ao longo de 3 h. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Para nocautear a Pax6 em organoides da glândula lacrimal de camundongos, um plasmídeo contendo o gRNA direcionado para Pax6 escolhido foi gerado por PCR e ligadura (Figura 4A). Este plasmídeo contendo gRNA foi eletroporado juntamente com os plasmídeos Piggy-Bac (plasmídeos contendo e contendo transposase de resistência à higromicina) e o editor de base C > T Cas9 em organoides da glândula lacrimal de camundongos dissociados em células únicas. Após 3 dias, quando os organoides se recuperaram, eles foram expostos à higromicina para selecionar clones que incorporaram o de resistência à higromicina. Em eletroporações bem-sucedidas, organoides resistentes à higromicina cresceram (Figura 4B). Os clones organoides em crescimento maiores que ~300 μm foram colhidos, idealmente antes de começarem a se diferenciar espontaneamente (Figura 4C). O DNA foi extraído de parte do organoide, mantendo-se o restante em cultura. A amplificação por PCR do locus Pax6 alvo do gRNA produziu uma banda de 367 pb para cada um dos clones escolhidos (Figura 4D). Após o sequenciamento do locus amplificado, clones homozigicamente editados em C > T (n = 1) foram mantidos. Por outro lado, clones não editados (n = 4), heterozigicamente editados ou editados incorretamente (n = 1) foram descartados (Figura 4E). Em geral, usando este gRNA visando Pax6, um clone homozigoto knock-out da glândula lacrimal de camundongo de seis sequenciados foi obtido. Alguns clones cresceram bem, mas alguns clones organoides foram perdidos após a colheita ou começaram a se diferenciar (Figura 4F). Dos 10 clones organoides colhidos, 7 cresceram bem.
Figura 4: Knock-out mediado por edição de base da Pax6 em organoides da glândula lacrimal de camundongos. (A) Traço de sequenciamento de Sanger do pFYF1320 após a integração correta do gRNA visando o locus Pax6. (B) Imagens de campo claro de organoides da glândula lacrimal de camundongos 5 dias após exposição à higromicina após eletroporação. Os organoides foram cultivados em meio de expansão de camundongos. À esquerda está um exemplo de eletroporação falhada, sem clone resistente à higromicina crescendo. À direita está um exemplo de eletroporação bem-sucedida, com vários clones organoides resistentes à higromicina sobrevivendo. (C) Imagens de campo brilhante de clones que devem ser escolhidos e clones que não devem ser selecionados. (D) Gel de agarose mostrando a amplificação do locus Pax6 alvo com o gRNA. Em verde, destaca-se a faixa do tamanho esperado de 367 pb. (E) Sequenciamento de Sanger de três clones organoides resistentes à higromicina. O clone superior não é editado. O clone do meio é uma edição C > T homozigótica e, portanto, um nocaute homozigoto. O clone de fundo apresenta duas mutações pontuais heterozigotas e é um knock-out heterozigoto ou um clone misto e foi editado erroneamente. (F) Imagens de campo brilhante dos clones organoides colhidos com vários níveis de crescimento. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Por fim, para a realização do transplante ortotópico organoide da glândula lacrimal humana em camundongos, foram utilizados organoides com 3 dias de antecedência (< de 100 μm de diâmetro). O enxerto organoide foi confirmado 1 mês após a injeção dos organoides na glândula lacrimal de camundongos pela coloração para um marcador humano-específico, o antígeno nucleolar humano (Figura 5). A ausência de coloração puntiforme em todos os cortes da glândula lacrimal de camundongos significou a ausência de enxerto organoide humano.
Figura 5: Transplante de organoides da glândula lacrimal humana para a glândula lacrimal de camundongo. Coloração de glândulas lacrimais de camundongos transplantados para o marcador nucleolar humano para monitorar o enxerto 1 mês após o transplante. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Tabela suplementar 1: Composição dos meios e buffers. Clique aqui para baixar esta tabela.
Este protocolo descreve o estabelecimento e o uso de organoides da glândula lacrimal para ensaios funcionais, modelagem de mutações e transplante. Ao estabelecer organoides da glândula lacrimal humana e de camundongos, a dissociação tecidual é crucial. Se o tecido não for suficientemente digerido, o rendimento organoide será baixo. Se o tecido for superdigerido, as células morrerão e não crescerão como organoides. Cada tecido deve ser digerido com uma enzima específica por um tempo específico para garantir o crescimento ideal dos organoides14,17,18. A glândula lacrimal é um tecido bastante mole para o qual uma digestão de colagenase de 5-10 min combinada com dissociação mecânica baseada em pipetagem é suficiente para isolar pequenos pedaços de tecido. Se células únicas precisarem ser obtidas para aplicações como o sequenciamento de RNA de célula única, a dissociação pode ser realizada por mais tempo até que o estágio de célula única seja atingido, mas a dissociação deve ser interrompida assim que células únicas forem obtidas para limitar qualquer diminuição na viabilidade. Como a dissociação tecidual é tão crucial, a digestão excessiva é a razão mais provável para a falha no estabelecimento organoide da glândula lacrimal.
A manutenção adequada dos organoides da glândula lacrimal é importante para o seu uso. A manutenção em longo prazo é uma característica dos organoides das glândulas lacrimais derivadas de células-tronco adultas, em comparação com organoides derivados de células-tronco pluripotentes induzidas 7,17. Para alcançar a manutenção a longo prazo, a divisão regular dos organoides e as mudanças médias devem ser realizadas. Sem isso, os organoides começam a se diferenciar e desenvolver diminuição do potencial das células-tronco, o que dificulta sua manutenção a longo prazo7. Nesta etapa novamente, a digestão excessiva pode matar as células-tronco e prejudicar a manutenção dos organoides. Para manutenção regular, a dissociação do organoide em células únicas não é necessária. No entanto, para gerar linhagens organoides nocaute clonal, é fundamental começar com células únicas. Caso contrário, os organoides serão constituídos por um mosaico de células com diferentes origens genéticas, impossibilitando a análise do efeito de uma única mutação definida. Aqui, descrevemos o uso de um editor de base C > T para gerar códons de parada. Este editor do genoma baseia-se na presença de arginina, glutamina, ou códons de triptofano dentro de 12-18 bases de um PAM NGG. Quando essas condições não são atendidas no projeto de um gRNA, editores convencionais de base Cas9 ou C>T com PAMs alternativos podem ser usados 7,18. No entanto, o Cas9 convencional introduz quebras de fita dupla que resultam em indels após o reparo11. Como ambos os alelos podem abrigar indéis diferentes, a genotipagem de clones requer cuidados adicionais. A deconvolução das modificações introduzidas deve ser realizada para garantir que ambos os alelos contenham indéis fora de quadro e, assim, que os clones organoides sejam nocauteados para o gene alvo19. A vantagem dos editores de base C > T reside no fato de que eles podem ser usados para modelar mutações pontuais que não resultam necessariamente em códons de parada. Por exemplo, eles podem ser usados para modelar mutações específicas da Pax6 encontradas em pacientes com aniridia para estudar seu impacto na fisiologia da glândula lacrimal20.
A glândula lacrimal secreta a parte aquosa do filme lacrimal1. A secreção lacrimal pode ser recapitulada em organoides humanos após diferenciação mediada pela retirada do fator de crescimento e inibição da NOTCH. Nessas condições, os organoides sofrem diferenciação terminal e não podem ser mantidos. No entanto, organoides diferenciados da glândula lacrimal podem guiar o desenvolvimento de drogas indutoras de lacrimejamento no contexto da doença do olho seco, potencialmente em telas de alto rendimento. O ensaio de lacrimejamento apresentado neste protocolo é o que atualmente proporciona a maior alteração no tamanho dos organoides em um curto espaço de tempo, o que facilita a quantificação no contexto de uma triagem de drogas 7,9,17.
A terapia com células-tronco é uma grande promessa para a regeneração da glândula lacrimal na doença do olho seco21. Organoides da glândula lacrimal derivados de células-tronco adultas podem ser um material fonte para tais aplicações. O protocolo aqui apresentado resulta na enxertia organoide da glândula lacrimal humana, principalmente na forma de cistos. Baixo enxerto organoide pode surgir devido a organoides sendo injetados no local errado. Treinar o procedimento de injeção com um corante permite o rastreamento do local de injeção e, em última análise, melhora a precisão da injeção. Alternativamente, a epiderme de camundongos pode ser incisada para ter acesso direto à glândula lacrimal, como feito em ratos antes de22. Este método leva mais tempo, mas pode ser mais preciso. Por outro lado, com o presente protocolo, os organoides não se integraram funcionalmente à glândula lacrimal de camundongos. Resultados semelhantes foram observados para o enxerto de glândula lacrimal derivado da iPSC22. O método de transplante poderia ser melhorado ferindo a glândula lacrimal com antecedência, usando um modelo de camundongo de olho seco e/ou injetando os organoides como células únicas ou pequenos aglomerados. No entanto, organoides da glândula lacrimal derivados de células-tronco adultas e o kit de ferramentas relacionado podem ser a base de futuras aplicações na pesquisa da glândula lacrimal e na medicina regenerativa.
Hans Clevers é o chefe de Pesquisa Farmacêutica e Desenvolvimento Inicial na Roche, Basileia, e detém várias patentes relacionadas à tecnologia de organoides.
Agradecemos a Yorick Post pelo desenvolvimento inicial do protocolo. Este trabalho foi em parte apoiado por um prêmio da Cancer Research UK Grand Challenge (C6307/A29058) e da Mark Foundation for Cancer Research para a equipe SPECIFICANCER.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1.5 mL safe-lock centrifuge tubes | Eppendorf | EP0030 120.094 | |
3,3′-Diaminobenzidine tetrahydrochloride hydrate (DAB) | Sigma-Aldrich | D5637 | CAS: 868272-85-9 , CAUTION, 6 g/L solution can be stored aliquotted at -20 °C |
5x green GoTaq Flexi buffer | Promega | M891A | Store at -20 °C |
A83-01 | Tocris | 2939 | Store at -20 °C, stock at 30 mM, 10000x |
Advanced DMEM/F12 | Invitrogen | 12634-010 | store at 4 °C |
Agar plates containing Ampicillin | Hubrecht Institute | ||
Ampicillin sodium salt | Sigma-Aldrich | A9518 | |
Autoclave VAPOUR-Line lite | VWR chemicals | ||
B27 supplement | Invitrogen | 17504-044 | Store at -20 °C, 50x |
BD Micro-Fine insulin needle 1 mL | BD Bioscience | 324825 | |
Benchtop microscope DMI1 | Leica | ||
Bovine serum albumine (BSA) | MP biomedicals | 160069 | Store at 4 °C |
BTXpress | BTX | MDS450805 | |
C57BL/6 mice | Hubrecht Institute | ||
Cassettes | Klinipath | 410-02S | |
CellBanker 1 | amsbio | 11910 | Cryopreservation medium, adhere to instructions |
Centrifuge | Eppendorf | ||
Citric acid monohydrate | J.T. Baker | 0088 | CAS: 5949-29-1 |
Collagenase I | Sigma Aldrich | C9407 | Aliquots at 20 mg/mL, 20x, store at -20 °C |
Conical tubes 15 mL | Greiner Bio-One | 5618-8271 | |
Conical tubes 50 mL | Corning | CLS430828-500EA | |
Coverslips 24 mm x 50 mm | Menzel-Gläzer | BB024050S1 | |
Cultrex Basement Membrane Extract (BME), Growth Factor Reduced, Type 2 - extracellular matrix | R&D Systems, Bio-Techne | 3533-001-02 | Store at -20 °C, keep at 4 °C for up to 1 month |
DAPT | Sigma Aldrich | D5942 | Store at -20 °C, stock at 10 mM, 1000x |
Disodium hydrogen phosphate anhydrous | VWR chemicals | 28026.292 | CAS: 7558-79-4 |
Di-sodiumhydrogenphosphate dihydrate | Sigma-Aldrich | 71643 | CAS:10028-24-7 |
Dispase | ThermoFisher Scientific | 17105-041 | Aliquots at 50 U/mL, store at -20 °C until use, 400x |
Disposable Scalpel Sterile N° 10 | Swann Morton | 3033838 | |
DM4000 microscope | Leica | ||
dNTPs 25 mM | Promega | U1420 | Mix all 4 nucleotides together, Store at -20 °C |
Dpn1 | New England Biolabs | R0176 | |
Dulbecco's Phosphate-bufferd Saline (DPBS) | Gibco | 14190144 | 1x |
Easy strainers 70 µm | Greiner | 542170 | |
Electroporation cuvette | Nepagene | EC002S | |
EnVision+/HRP mouse | Agilent | K400111-2 | |
Ethanol 100% | BOOM | 84045206;5000 | CAUTION, Use to prepare other Ethanol dilutions |
Ethanol 70% | BOOM | 84010059.5000 | CAUTION |
Ethanol 96% | BOOM | 84050065.5000 | CAUTION |
EVOS FL Auto 2 Cell Imaging System | ThermoFisher Scientific | Live-imaging brightfield microscrope | |
FGF10 | Peprotech | 100-26 | Store at -20 °C, stock at 100 mg/mL in base medium, 100x |
Fiji | NIH, Fiji developers | ||
Formaldehyde solution 4% | Sigma-Aldrich | 1.00496 | CAS: 50-00-0, CAUTION |
Forskolin | Tocris | 1099 | Store at -20 °C, stock at 10 mM, 10000x |
Glutamax | Gibco | 35050-061 | 100x |
GoTaq G2 Flexi DNA Polymerase | Promega | M7805 | Store at -20 °C |
Haematoxylin | VWR chemicals | 10047105 | Store at room temperature |
HEPES | Gibco | 15630-080 | Store at 4 °C, 100x |
Histocore H and C, Tissue embedding machine | Leica | ||
Hot plate | Meidax | ||
Human nucleolar antigen antibody | Abcam | ab-190710 | |
Hydrochloric acid 5 N | ThermoFisher Scientific | 10605882 | CAS: 7647-01-0, CAUTION |
Hydrogen peroxyde 30% | Chem-lab | CL00.2308.1000 | CAS: 7722-84-1, CAUTION |
Hygromycin B-gold | InvivoGen | ant-hg | Stock at 100 mg/µL, 1000x |
Hygromycin resistance cassette-containing plasmid | Andersson-Rolf et al, Nature Methods, 2017. doi: 10.1038/nmeth.4156 | ||
IsoFlo 100% | Mecan | 5960501 | |
LB medium | Hubrecht Institute | ||
MgCl2 25 mM | Promega | A351H | Store at -20 °C |
Microtome RM2235 | Leica | ||
Midiprep DNA isolation kit | ThermoFisher Scientific | K210005 | |
Miniprep DNA isolation kit | ThermoFisher scientific | K210003 | |
N-acetylcysteine | Sigma Aldrich | A9165 | Store at -20 °C, stock at 500 mM, 400x |
NEPA21 electroporator | Nepagene | ||
Nicotinamide | Sigma Aldrich | N0636 | Store at -20 °C, stock at 1M, 100x |
NOD Scid Gamma (NSG) mice | Hubrecht Institute colony | ||
Noggin conditioned medium | U-Protein Express | Custom order | Store at -20 °C |
Noradrenaline | Sigma Aldrich | A7257 | Store at -20 °C, stock at 100 mM |
Oven | Memmert | Set at 58 °C | |
P20, P200 and P1000 pipettes | Gilson | ||
Paraffin | VWR chemicals | 10048502 | |
Pasteur pipettes, glass plugged | ThermoFisher Scientific | 1150-6973 | |
Pax6_C>T_F: AGACTGTTCCAGGATGGCTG | IDT | ||
Pax6_C>T_R: TCTCCTAGGTACTGGAAGCC | IDT | ||
pCMV_ABEmax_P2A_GFP | Addgene | 112101 | |
Penicillin/Streptomycin | Invitrogen | 15140-122 | Store at -20 °C |
Pertex | Klinipath | AM-08010 | |
pFYF1320 | Addgene | 47511 | |
Primocin | InvivoGen | ant-pm-1 | 1000X, store at -20 °C |
Prostaglandin E2 (PGE2) | Tocris | 2296 | Store at -20 °C, stock at 10 mM, 10000x |
Petri dish, 10 cm | Greiner | 633102 | |
Q5 buffer | New England Biolabs | B9027S | |
Q5 high-fidelity DNA polymerase | New England Biolabs | M0491S | |
QIAquick Gel Extraction Kit | Qiagen | 28704 | |
QuickExtract DNA Extraction Solution | Lucigen | QE09050 | Store aliquots at -20 °C |
R-spondin 3 conditioned medium | U-Protein Express | Custom order | Store at -20 °C |
sgRNA Reverse Primer: TCTGCGCCCATCTGTTGCTT CGGTGTTTCGTCCTTTCCACAAG | IDT | ||
Slides | StarFrost | MBB-0302-55A | Adhesive, ground |
Sodium azide | Merck | 8.22335.1000 | CAS: 26628-22-8, CAUTION |
Sodium cytrate dihydrate | J.T. Baker | 0280 | CAS: 6132-04-3 |
Standard Forward Primer: “/5phos/ GTTTTAGAGCTAGAAATAGCAAG TTAAAATAAGGC | IDT | ||
Subcloning efficiency competent cells DH5alpha | Invitrogen | 18265-017 | |
Suspension cell culture plates (24-well) | Greiner Bio-One | 662102 | 24-well |
Suspension cell culture plates (12-well) | Greiner Bio-One | 665102 | 12-well |
T4 DNA ligase | New England Biolabs | M0202 | |
TAE buffer | ThermoFisher Scientific | B49 | Stock at 50x, dilute to 1x with ultrapure water |
Transposase-containing plasmid | Andersson-Rolf et al, Nature Methods, 2017. doi: 10.1038/nmeth.4156 | ||
TrypLE Express Enzyme | Invitrogen | 12605-028 | store at 4 °C |
U6_Forward primer: GGGCAGGAAGAGGGCCTAT | IDT | ||
UltraPure Agarose 1000 | Invitrogen | 16550 | |
Water bath | Tulabo | ||
Xylene | Klinipath | 4055-9005 | CAS: 1330-20-7, CAUTION |
Y-27632 | Abmole Bioscience | Y-27632 dihydrochloride | Store at -20 °C, stock at 10 mM, 1000x |
Solicitar permissão para reutilizar o texto ou figuras deste artigo JoVE
Solicitar PermissãoThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. Todos os direitos reservados