이 작품은 자연 과학 재단의 장쑤 성 (BK20140919), 국립 자연 과학 재단의 중국 (31470375), 우선 교육 프로그램 개발의 장쑤 등 교육 기관 및 청 Lan 프로젝트에 의해 지원 되었다.

1. 식물 (8 주)의 준비
<ol><li>5% NaClO 0.1% 트라이 톤 X-100 (V/V) 솔루션 및 두고 씨앗 소독을 5 분의 1 mL를 포함 한 1.5 mL microcentrifuge 튜브에서 50 Nicotiana benthamiana 씨앗을 넣어.</li>
	<li>5 번 살 균 물으로 종자를 헹 굴 하 고 살 균 물 200 µ L에서 씨앗을 일시 중단.</li>
	<li>신중 하 게 장소 개별 씨앗 MS-한 천 매체 (1 l: 重 & Skoog 소금 10 g 자당, pH 5.8 x 1 (코), 1 %agar) 좋은 팁 및 발 아 동기화를 3 일 동안 4 ° C에 게 중간 접시의 표면에. 참고: 미생물 오염을 방지 하려면 클린 벤치에이 단계를 수행 합니다. 살 균 동안 튜브를 흔들 필요는 없습니다.</li>
	<li>10 일 동안, 정상적인 성장 조건 (22 ° C, 80-90 µmolm-2의-1 흰 빛의 강도)에서 중간 접시 놓고 토양으로 세균된 묘를 전송 합니다. 참고: 토양에 모 종 뿌리를 삽입 하 고 뿌리를 손상 하지 마십시오. 투명 한 플라스틱 커버와 하룻밤 습도 유지 하기 위해 트레이 커버.</li>
	<li>16 h/8 h 명암 주기 및 70% 습도에 제어 성장 방에 식물을 성장 한다. 7 주 된 명. benthamiana 식물 Agrobacteriumtumefaciens 침투 (그림 1A)에 대 한 준비가 되었습니다. 참고: 식물을 급수 하 고 식물의 건강을 유지 하는 데 필요한 해충을 제어.</li>
</ol>2. 과도 식 명 Benthamiana 잎 (7-10 일)
<ol><li>플라스 미드의 배달 150 ng (pEGAD-하-뤽 제어 플라스 미드, 빈 벡터 및 국제 협회에 대 한 생성 된 플라스 미드 분석 결과,이 경우에 우리가 사용 pCAMBIA1300 Nluc 및 pCAMBIA1300 Cluc 플라스 미드 건설) A. tumefaciens 유능한 세포로 변형으로 GV3101는 표준 electroporation 방법입니다.</li>
	<li>Luria Bertani (파운드) 한 천 매체 (1 l: 10 g NaCl, 5 g 효 모 추출 물, 10 g tryptone 1.5 %agar) 포함 50 µ g/mL 대와 4 일 동안 28 ° C에서 리 팜 피신의 50 µ g/mL에 문화 A. tumefaciens 참고: 벡터 및 사용 A. tumefaciens 변형에 따라 항생제의 선택 합니다.</li>
	<li>접종 한 파운드 50 µ g/mL 대과 리 팜 피신의 50 µ g/mL를 포함 하는 액체 매체의 3 mL에 각 접시에서 A. tumefaciens 식민지를 단일 및 24 h 셀 문화 전파를 위한 28 ° C에서 220 rpm에 흔들.</li>
	<li>15 mL 신선한 파운드 액체 매체 포함 된 50 µ g/mL 대과 리 팜 피신, 200 배 희석의 50 µ g/mL로 75 µ L 세균성 문화를 전송 합니다. OD600 0.5에서 1.0 사이 때까지 약 8 시간, 30 ° C에서 220 rpm에서 박테리아를 문화.</li>
	<li>A. tumefaciens 액체 문화 15 mL 원심 분리기 튜브에 전송 하 고 4000 x g와 15 분 삭제는 상쾌한 4 ° C 원심 펠 릿을 세척 하 변환 솔루션의 15 mL에 펠 릿을 중단.</li>
	<li>4000 x g와 15 분 동안 4 ° C 튜브를 회전 하 고는 상쾌한 삭제. 다시 한 번 세척 단계를 반복 합니다.</li>
	<li>변환 솔루션의 5 mL에 펠 릿을 resuspend 하 고 실 온에서 2 h 동안 유지. OD600 의 최종 농도 0.5, 또는 테스트 쌍을 이루는 단백질 상호 작용에 대 한 동등한 양으로 혼합 두 샘플까지 변환 솔루션 A. tumefaciens 펠 릿 셀의 밀도 조정 합니다.</li>
	<li>7 4번째 에 침투 중단 셀일 단풍 1 mL needleless 주사 통 (그림 1B-C). 침투 후 검은색 플라스틱 커버와 함께 즉시 식물을 커버 하 고 12 h에 대 한 어둠 속에서 트레이 놓습니다. 그 후, 평소 뤽 활동을 검출 하기 전에 2 ~ 4 일에 대 한 식물을 성장. 참고: 비슷한 크기의 건강 한 잎을 선택 합니다. 한 잎에 4 개의 다른 영역의 침투는 괜 찮 아 요.</li>
</ol>3. 감지 Luciferase 활동 (1 일)
참고: luciferase 활동을 모니터링 하는 두 가지 방법이 있다. 하나는 이미징, 기반 그리고 다른 양적 luciferase 활동을 측정 하는 것입니다.
<ol><li>
이미징 방법
	<ol>
<li>침투 잎을 분리 하 고 MS-한 천 매체에 전체 전단지를 넣어.</li>
		<li>스프레이 50 mL 스프레이 용기와 표면에 잎 adaxial 소 작업 버퍼입니다. 엽록소 자동 형광 담금질 하기 위해 5 분 동안 어둠 속에서 자료를 유지.</li>
		<li>이미지 (그림 2)를 (-30 ° C에 냉각) 장치 이미징 낮은 조명 냉각된 CCD를 사용 합니다. 빛에 신청 노출 시간이 50 밀리초 이며 발광 검출 시간은 1 분입니다. 참고: 컴퓨터 매뉴얼에 따라 매개 변수를 조정 합니다. 낮은 온도 이미지 품질을 향상 시키기 위해 신호-잡음 비율을 강화할 것 이다.</li>
	</ol>
</li>
	<li>또는, 상업적인 루미 노와 직접 발광을 측정 합니다.<ol>
<li>조심 스럽게 명. benthamiana 잎의 침투 지역에서 (약 0.25 cm2) 잎 조각을 잘라 고 잎 디스크 100 µ L 96 잘 흰 접시 (그림 3)에서 이온 물에 담가.</li>
		<li>소 작업 버퍼의 10 µ L을 추가 하 고 5 분 동안 둡니다. 그런 다음 특정 치료 단백질 상호 작용 역학 연구를 수행 합니다. 참고: 특정 치료에서 단백질 단백질 상호 작용의 활동을 나타내는 luciferase 활동 역학을 얻을 다른 시간 지점에서 루미 노와 발광을 감지 합니다. 이 메서드는 동시에 많은 수의 단백질 쌍을 테스트에 대 한 이점이 있다. 서쪽 오 점 여 luciferase 단백질 나타났는데 검사 그 상업 루미 노 하지 않고, 따라서 뤽 활동 quantitively를 참조 하십시오. 빛이 반드시 필요한 경우 단지는 루미 노에 접시를 유지 하 고 다른 시간 지점에서 발광을 측정. 그렇지 않으면 검출 간격 동안 성장 챔버에 접시를 이동 합니다. 적어도 3 개의 생물 복제를 사용 하 여 통계적으로 유의 한 결과 얻을. 루크 활동 다른 침투 영역에서 달라 지기는 하지만 그들의 변화 패턴 일치 하는 정규화 후입니다.</li>
	</ol>
</li>
</ol>

<ol>
	<li>Thines, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=JAZ+repressor+proteins+are+targets+of+the+SCF(COI1)+complex+during+jasmonate+signalling.">JAZ repressor proteins are targets of the SCF(COI1) complex during jasmonate signalling.</a> Nature. 448, 661-665 (2007).</li><li>Chini, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+JAZ+family+of+repressors+is+the+missing+link+in+jasmonate+signalling.">The JAZ family of repressors is the missing link in jasmonate signalling.</a> Nature. 448, 666-671 (2007).</li><li>Jones, A. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Border+control--a+membrane-linked+interactome+of+Arabidopsis.">Border control--a membrane-linked interactome of Arabidopsis.</a> Science. 344, 711-716 (2014).</li><li>Arabidopsis Interactome Mapping Consortium. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evidence+for+network+evolution+in+an+Arabidopsis+interactome+map.">Evidence for network evolution in an Arabidopsis interactome map.</a> Science. 333, 601-607 (2011).</li><li>Yazaki, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mapping+transcription+factor+interactome+networks+using+HaloTag+protein+arrays.">Mapping transcription factor interactome networks using HaloTag protein arrays.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 113, 4238-4247 (2016).</li><li>Kenworthy, A. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaging+protein-protein+interactions+using+fluorescence+resonance+energy+transfer+microscopy.">Imaging protein-protein interactions using fluorescence resonance energy transfer microscopy.</a> Methods. 24, 289-296 (2001).</li><li>Walter, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualization+of+protein+interactions+in+living+plant+cells+using+bimolecular+fluorescence+complementation.">Visualization of protein interactions in living plant cells using bimolecular fluorescence complementation.</a> Plant J. 40, 428-438 (2004).</li><li>Chen, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Firefly+luciferase+complementation+imaging+assay+for+protein-protein+interactions+in+plants.">Firefly luciferase complementation imaging assay for protein-protein interactions in plants.</a> Plant Physiol. 146, 368-376 (2008).</li><li>Layton, C. J., Hellinga, H. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitation+of+protein-protein+interactions+by+thermal+stability+shift+analysis.">Quantitation of protein-protein interactions by thermal stability shift analysis.</a> Protein Sci. 20, 1439-1450 (2011).</li><li>Schuck, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reliable+determination+of+binding+affinity+and+kinetics+using+surface+plasmon+resonance+biosensors.">Reliable determination of binding affinity and kinetics using surface plasmon resonance biosensors.</a> Curr Opin Biotechnol. 8, 498-502 (1997).</li><li>Huang, X., Ouyang, X., Deng, X. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Beyond+repression+of+photomorphogenesis:+role+switching+of+COP/DET/FUS+in+light+signaling.">Beyond repression of photomorphogenesis: role switching of COP/DET/FUS in light signaling.</a> Current opinion in plant biology. 21, 96-103 (2014).</li><li>Liu, B., Zuo, Z., Liu, H., Liu, X., Lin, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Arabidopsis+cryptochrome+1+interacts+with+SPA1+to+suppress+COP1+activity+in+response+to+blue+light.">Arabidopsis cryptochrome 1 interacts with SPA1 to suppress COP1 activity in response to blue light.</a> Genes Dev. 25, 1029-1034 (2011).</li><li>Lian, H. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Blue-light-dependent+interaction+of+cryptochrome+1+with+SPA1+defines+a+dynamic+signaling+mechanism.">Blue-light-dependent interaction of cryptochrome 1 with SPA1 defines a dynamic signaling mechanism.</a> Genes Dev. 25, 1023-1028 (2011).</li><li>Zuo, Z., Liu, H., Liu, B., Liu, X., Lin, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Blue+light-dependent+interaction+of+CRY2+with+SPA1+regulates+COP1+activity+and+floral+initiation+in+Arabidopsis.">Blue light-dependent interaction of CRY2 with SPA1 regulates COP1 activity and floral initiation in Arabidopsis.</a> Curr Biol. 21, 841-847 (2011).</li></ol>

저자는 공개 없다.

여기에 설명 된 프로토콜은 간단 하 고 vivo에서 단백질-단백질 상호 작용, 공부에 대 한 재현 고 외 인 치료에서 단백질 상호 작용 역동성을 감지 하는 데 특히 적합. 이 분석 결과 주요 단계 명. benthamiana 침투입니다. 성공을 보장 하기 위해 침투, 식물 매우 건강 해야 합니다. 또 다른 중요 한 요인은 침투 후 luciferase 활동을 확인 하는 시기입니다. 이 질문에 대 한 정확한 대답이 있다. 연구원은 다른 일은 luciferase 높은 수준에서 표시 됩니다 때 우리가 관찰 시간8변동 단백질 표정 수준 때문에 판단에 침투 후에 luciferase 활동을 모니터링 하는 것이 좋습니다.
그것은 가능한 아무 발광 실험에서 검색 될 수 있습니다. 적절 한 컨트롤 없이 false 네거티브를 제외할 수 없습니다. 전체 길이 luciferase 제어는 침투와 luciferase 탐지 작동을 증명 하기 위해 필요 합니다. 다음 거기에 아직도 아무 발광 상 상속 단백질 상호 작용 쌍, 경우에 하나 또는 두 개의 단백질 성공적으로 표현 되지 않는다는 immunoblot 단백질 식 감지 하 요구 것입니다. 마지막 가능성은 단백질 상호 작용 단백질 구조적 이유로 인해 luciferase 보완성을 방해할 수 있습니다. 이 경우, 단백질 또는 단백질 퓨전 N-루크와 전환 자를 사용 하 여 또는 C-뤽이이 문제를 해결 하기 위해 도움이 될 것입니다.
Protoplasts는 또한 과도 식에 대 한 인기가, protoplasts 및 원생 동물 세포로 플라스 미드의 특정 전문성을 필요로 하며 유해한 CsCl2 대규모 플라스 미드 추출에 대 한. 또한, 원생 동물 격리 동안 식물은 심하게 부상는 PPI 분석 실험에 영향을 미칠 수 있습니다.
아니 황금 표준 분석 결과가입니다. 우리의 지식을 하려면이 쉽게 수행된 luciferase 보완성 분석 결과 유용 단백질 상호 작용 속도 론 정보를 제공할 수 있습니다. 물론, 단백질 상호 작용에서 vivo에서 공부에 대 한 대체 방법을 이러한 결과 확인 하 고 셀에 생 화 확 적인 사건의 이해를 향상 시킬 것입니다.

환경과 성장 조정 하려면 식물 감각, transduce, 신호 신호에 응답 하는 우아한 신호 경로 진화해왔다. 릴레이 경주에서 주자 처럼 단백질은 식물 신호 변환에 필요한 선수. 그것은 널리 인정 되었습니다 단백질 단백질 상호 작용 (PPI) 셀룰러 통신에 대 한 주요 역할을 한다. 단백질 인 산화, acetylation, 및 저하 모두 대상 단백질 및 그것의 수정 효소 간의 실제 상호 작용에 따라 달라 집니다. 예를 들어 Jasmonate ZIM 도메인 단백질 (JAZ) 가족 단백질 녹음 방송 요인 MYC2와 상호 작용 하 고는 transcriptional 활동1,2를 억제. PPI의 중요성을 감안할 때 대규모 단백질 interactomes 식물에 되었습니다 탐험 최근3,,45. 이러한 위하여 결과 더 다양 한 세포 기능을 조정 하는 복잡 한 규제 네트워크 공개.
PPI를 모니터링 하기 위한 몇 가지 설립된 접근이 있다. 효 모 2 잡종 (Y2H) 분석 결과 PPI 탐지에 대 한 가장 널리 사용 되는 방법입니다. Y2H를 수행 하기 쉽고 단백질 상호 작용을 검사 하는 빠른 테스트를 위해 적당 한 이다. Y2H는 관심의 특정 단백질에 대 한 알 수 없는 상호 파트너 심사 또한 널리 이용 된다. 그러나, Y2H은 효 모에 전적으로 실시 하기 때문에 그것은 수 없습니다 반영 공장에서 실제 시나리오 세포 높은 거짓 긍정적인 요금을 가져온다. 또 다른 유사한 전략은 풀 다운 분석 결과 이다. 일반적으로, 두 단백질은 표현 및 대장균 세포에서 정화와 혼합 그리고 단백질 상호 작용 검출을 위한 움직일 수 있습니다. 이 방법은 시간이 오래 걸릴 하지 않습니다, 비록 그것은 얻을 수 없습니다 vivo에서 상호 작용 결과 중 하나. 목적을 위해 비보에 상호 작용, 공동-immunoprecipitation (공동-IP) 고품질 immunoprecipitate 관심의 단백질에 항 체를 요구 하 고 간접 PPIs의 가능성을 제외 수는 가장 인기 있는 분석 결과 이다. 또한, 공동-IP에 복잡 한 실험 절차 때문 결과 일반적으로 개별 전문성을 갖춘 다.
기자 기반으로 재구성 분석 실험은 크게 vivo에서 PPI의 탐지 사전. 이러한 방법에는 형광 공명 에너지 전달 (무서 워)6, 분자 형광 보완성 (BiFC)7및 이미징 (협회) 분석 결과8반딧불 luciferase 보완성 포함 됩니다. 있지만 이러한 세 가지 방법 공동 IP 보다는 직접 vivo에 맞게 PPI, 무서 워, BiFC 특정 현미경 형광 신호 필요와 쉽게 상호 작용 강도 정할 수 없습니다. 반면, 협회의 기판 소 반응 후 놀 것 이다 반딧불 luciferase의 활용. 더 중요 한 것은, PPI 강도 luciferase 활동의 값에서 확인할 수 있습니다. 따라서, 협회는 뿐만 아니라 두 단백질 상호 작용, 하지만 또한 치료 시 상호 작용 역동성에 정보를 제공 합니다 여부를 나타냅니다. 비록 몇 가지 설정된 방법이 상호 역학 (표면 플라스몬 공명 또는 온도 안정성 교대 기준)9,10, 모니터링을 위한 섬세 한 악기 또는 특정 라벨이 방법 필요 합니다. 반면, 협회 수행 하 고 검색 하기가 쉽습니다.
국제 협회에 대 한 원리는 아미노 터미널과 carboxyl 터미널 반쪽 luciferase (라는 N-뤽 또는 C-뤽, 각각)의 A와 B, 단백질과 단백질 식물 세포에 동시에 표현 했다이 두 퓨전으로 융합 했다. 단백질 A, 단백질 B와 상호 작용 하는 경우 다음 luciferase의 두 반쪽 됩니다 수 재구성 된다 될 활성 luciferase 효소. 루미 노 또는 CCD 카메라 luciferase 활동을 감지할 수 있습니다. 그것은 협회;에 대 한 안정 된 transformants를 얻을 필요가 없습니다. 과도 식 고급 상호 작용 결과 얻기에 충분 하다.
링 타입 E3 유비퀴틴 리가 제정 photomorphogenic 1 (COP1) 녹음 방송 요인의 무수 한와 상호 작용 하 고 26S 프로테아좀11그들의 저하를 촉진 합니다. 이러한 COP1 대상 녹음 방송 요인 중 일부는 photomorphogenesis에 대 한 긍정적인 레 귤 레이 터입니다. 어둠 속에서 COP1 phytochrome A-105 1 (SPA1), COP1 E3 활동8향상의 억압으로 작용 합니다. 빛의 지 각, 후 대뇌 COP1 활동을 억제 하 고 COP1 기판12,,1314다음 안정화 COP1-SPA1 상호 작용을 파기 됩니다. 이 예제에서는 PPI를 공부 하 고 PPI 역학 생물 학적 의미를 보여 줍니다.

<table style="border-collapse:collapse;width:686pt" width="915">
	<colgroup>
		<col style="width:293pt" width="390" />
		<col style="width:140pt" width="186" />
		<col style="width:140pt" width="187" />
		<col style="width:114pt" width="152" />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="28" style="height:21.0pt">
			<td class="xl16" height="28" style="width:293pt;height:21.0pt" width="390">Transformation solution</td>
			<td class="xl16" style="width:140pt" width="186"></td>
			<td class="xl16" style="width:140pt" width="187"></td>
			<td style="width:114pt" width="152"></td>
		</tr>
		<tr height="28" style="height:21.0pt">
			<td class="xl17" height="28" style="width:293pt;height:21.0pt" width="390">10 mM Morpholineethanesulfonic acid</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="186">VETEC</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="187">V900336&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="28" style="height:21.0pt">
			<td class="xl17" height="28" style="width:293pt;height:21.0pt" width="390">27.8 mM Glucose</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="186">VETEC</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="187">V900392</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="32" style="height:24.0pt">
			<td class="xl18" height="32" style="width:293pt;height:24.0pt" width="390">10 mM MgCl2&#215;6H2O</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="186">VETEC</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="187">V900020&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="28" style="height:21.0pt">
			<td class="xl17" height="28" style="width:293pt;height:21.0pt" width="390">150 &#956;M Acetosyringone</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="186">ALDRICH</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="187">D134406&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="28" style="height:21.0pt">
			<td class="xl17" height="28" style="width:293pt;height:21.0pt" width="390">pH 5.7</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="186"></td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="187"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="28" style="height:21.0pt">
			<td class="xl16" height="28" style="width:293pt;height:21.0pt" width="390">Luciferin working buffer</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="186"></td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="187"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="56" style="height:42.0pt">
			<td class="xl17" height="56" style="width:293pt;height:42.0pt" width="390">5 mM Luciferin potassium salt</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="186">GOLD BIOTECHNOLOGY</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="187">LUCK-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="28" style="height:21.0pt">
			<td class="xl17" height="28" style="width:293pt;height:21.0pt" width="390">0.025% Triton X-100</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="186">VETEC</td>
			<td class="xl17" style="width:140pt" width="187">V900502&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="32" style="height:24.0pt">
			<td class="xl17" height="32" style="width:293pt;height:24.0pt" width="390">H2O to 10 ml</td>
			<td class="xl21"></td>
			<td class="xl21"></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

luciferase complementation imaging assay in nicotiana benthamiana leaves for transiently determining protein-protein interaction dynamics

단백질 단백질 상호 작용은 릴레이 신호 변환 가장 세포질 과정;에 대 한 기본 메커니즘 그러므로, 소설 단백질-단백질 상호 작용 쌍 및 단백질 상호 작용 역동성을 모니터링 드러내는 식물 환경 요인 및 발달 신호에 응답 하는 방법에 대 한 특별 한 관심의 이다. 접근의 과다 단백질 단백질 상호 작용, 체 외에서 또는 vivo에서검토 개발 되었습니다. 그 중 최근에 설립 된 luciferase 보완성 (협회) 이미징 분석 결과가 이다 vivo에서 단백질-단백질 상호 작용 위한 간단 하 고 빠른 방법. 이 분석 결과에서 단백질 또는 단백질 B는 융합 luciferase의 아미노 맨끝 또는 carboxyl 터미널 반 각각. 단백질 단백질 B로 할 때, luciferase의 두 반쪽 기능과 활성 luciferase 효소를 형성 하는 재구성 된다 것입니다. 루미 노 또는 CCD 카메라 luciferase 활동을 기록할 수 있습니다. 다른 방식에 비해, 질적 및 양적 협회 분석 결과 단백질 단백질 상호 작용을 보여줍니다. Nicotiana benthamiana 잎에서 Agrobacterium 침투 과도 단백질 표정에 대 한 널리 사용된 시스템입니다. 협회 및 과도 식의 조합으로, 이러한 접근 COP1와 SPA1 간의 실제 상호 작용 jasmonate 치료 후 서서히 감소 되었다 보여줍니다.

세 가지 주요 단계 단백질 단백질 상호 작용에서 vivo에서, 식물 성장, luciferase 분석 결과, 담배 침투 등 공부에 대 한이 luciferase 보완성 프로토콜에 점찍어 될 수 있습니다. 이 프로토콜의 가장 중요 한 단계는 액체 A. tumefaciens 명. benthamiana 잎 (그림 1)에 침투 하는 것은.
여기에 jasmonate COP1-SPA1 상호 작용을 감소를 확인 하는이 기술의 유용의 예가입니다. Luciferase 아미노 터미널과 carboxyl 터미널 반 COP1 융합 했다 (COP1-NLuc) 또는 SPA1 (CLuc-SPA1), 각각. COP1-SPA1 상호 작용 기능 luciferase 보완성에 결과. Luciferase 활동 했다 (그림 2), CCD 카메라에 의해 몇 군데 하 고 효소 활동은는 루미 노 (그림 3)와 검출 될 수 있다. 자체 그 luciferase 가능성을 제외 하는 처리에 의해 영향을, 전체 길이 luciferase (루크) 유전자는 또한 정도 명. benthamiana 잎 컨트롤 역할을 표현. Jasmonate 치료 (시간 0) 전에 luciferase 활동 1로 설정 하 고 각 luciferase 활동 값이 jasmonate 치료에서 얻은 시간 0 상대 luciferase 활동 (그림 4)와 정규화 되었는지. 결과 COP1 SPA1 상호 작용 (luciferase 활동에 의해 반영 되는) 점차적으로 어둠 속에서 거부 그리고 그 자 치료는 더 그들의 상호 작용을 감소.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56641/56641fig1.jpg"> 그림 1 . 명. benthamiana 침투에 대 한 프로세스입니다.  (A) Abaxial와 침투 하기 전에 식물의 adaxial 보기. 대표 이미지 (B) 침투 프로토콜 표시입니다. (C) Abaxial와 침투 후 식물의 adaxial 보기. <a href="//cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56641/56641fig1large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56641/56641fig2.jpg"> 그림 2 . CCD 카메라에서 영상 luciferase 활동입니다.  (A) 정상적인 가벼운 분야에서 한 명. benthamiana 잎의 대표 이미지. (B) 검색 발광 신호 CCD 카메라 아래 luciferase 활동을 보여. <a href="//cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56641/56641fig2large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56641/56641fig3.jpg"> 그림 3. 에서 발광을 측정 하는 방법을 보여을 대표 이미지 컷 리프 디스크.  침투 잎 디스크를 잘라내어 발광 신호를 측정 하기 위한 흰색 96 잘 접시에 넣어 했다. <a href="//cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56641/56641fig3large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56641/56641fig4.jpg"> 그림 4 . 대표 한 과도 luciferase 보완성 분석 결과에서 유래한 다.  (A) 치료 기간 (시간) 및 발광 값 (루크 활동)의 원래 결과 나와 있었다. 각 샘플에 대 한 3 개의 독립적인 복제 있다. 이 차트를 준비 하기 위한 다른 치료 시간 지점에서 루크 활동은 시간 0 상대 뤽 활동으로 정규화 됩니다. (B) 어둠 속에서 서서히 COP1 SPA1 상호 작용을 보여주는 상대 뤽 활동의 정량화 거부는 더 자 처리에 의해 감소 될 수 있다. 오차 막대는 표준 편차 (sd)를 나타냅니다. <a href="//cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56641/56641fig4large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.</a>

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Luciferase Complementation Imaging Assay in Nicotiana benthamiana Leaves for Transiently Determining Protein-protein Interaction Dynamics

Luciferase 보완성 이미징 분석 결과 Nicotiana benthamiana 잎 뚜렷이 결정 단백질 단백질 상호 작용 역동성에 대 한

이 원고 luciferase 활동의 측정에 기반 하는 단백질 단백질 상호 작용을 결정 하기 위한 간단 하 고 신속한 실험 절차를 설명 합니다.

Protein-protein interactions are fundamental mechanisms for relaying signal transduction in most cellular processes; therefore, identification of novel ...

luciferase-complementation-imaging-assay-nicotiana-benthamiana-leaves

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Biology

Luciferase Complementation Imaging Assay in Nicotiana benthamiana Leaves for Transiently Determining Protein-protein Interaction Dynamics

13.8K 조회수.  Nanjing Normal University. 이 원고 luciferase 활동의 측정에 기반 하는 단백질 단백질 상호 작용을 결정 하기 위한 간단 하 고 신속한 실험 절차를 설명 합니다.

비디오: Luciferase Complementation Imaging Assay in Nicotiana benthamiana Leaves for Transiently Determining Protein-protein Interaction Dynamics

Virus-induced Gene Silencing (VIGS) in Nicotiana benthamiana and Tomato

RNA interference (RNAi) is a highly specific gene-silencing phenomenon triggered by dsRNA1. This silencing mechanism uses two major classes of RNA regulators: microRNAs, which are produced from non-protein coding genes and short interfering RNAs (siRNAs). Plants use RNAi to control transposons and to exert tight control over developmental processes such as flower organ formation and leaf development2,3,4. Plants also use RNAi to defend themselves against infection by viruses. Consequently, many viruses have evolved suppressors of gene silencing to allow their successful colonization of their host5.
Virus-induced gene silencing (VIGS) is a method that takes advantage of the plant RNAi-mediated antiviral defense mechanism. In plants infected with unmodified viruses the mechanism is specifically targeted against the viral genome. However, with virus vectors carrying sequences derived from host genes, the process can be additionally targeted against the corresponding host mRNAs. VIGS has been adapted for high-throughput functional genomics in plants by using the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens to deliver, via its Ti plasmid, a recombinant virus carrying the entire or part of the gene sequence targeted for silencing. Systemic virus spread and the endogenous plant RNAi machinery take care of the rest. dsRNAs corresponding to the target gene are produced and then cleaved by the ribonuclease Dicer into siRNAs of 21 to 24 nucleotides in length. These siRNAs ultimately guide the RNA-induced silencing complex (RISC) to degrade the target transcript2.
Different vectors have been employed in VIGS and one of the most frequently used is based on tobacco rattle virus (TRV). TRV is a bipartite virus and, as such, two different A. tumefaciens strains are used for VIGS. One carries pTRV1, which encodes the replication and movement viral functions while the other, pTRV2, harbors the coat protein and the sequence used for VIGS6,7. Inoculation of Nicotiana benthamiana and tomato seedlings with a mixture of both strains results in gene silencing. Silencing of the endogenous phytoene desaturase (PDS) gene, which causes photobleaching, is used as a control for VIGS efficiency. It should be noted, however, that silencing in tomato is usually less efficient than in N. benthamiana. RNA transcript abundance of the gene of interest should always be measured to ensure that the target gene has efficiently been down-regulated. Nevertheless, heterologous gene sequences from N. benthamiana can be used to silence their respective orthologs in tomato and vice versa8.

Virus-induced Gene Silencing VIGS in Nicotiana benthamiana and Tomato

Description of a virus-induced gene silencing (VIGS) method for knock-down of gene expression in Nicotiana benthamiana and tomato.

바이러스 유도 진 입을 (VIGS)에 Nicotiana benthamiana 토마토

RNA interference (RNAi) is a highly specific gene-silencing phenomenon triggered by dsRNA1. This silencing mechanism uses two major classes of RNA ...

연구

생물학

Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) Assay for Protein-Protein Interaction in Onion Cells Using the Helios Gene Gun

Investigation of gene function in diverse organisms relies on knowledge of how the gene products interact with each other in their normal cellular environment. The Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) Assay1 allows researchers to visualize protein-protein interactions in living cells and has become an essential research tool. This assay is based on the facilitated association of two fragments of a fluorescent protein (GFP) that are each fused to a potential interacting protein partner. The interaction of the two protein partners would facilitate the association of the N-terminal and C-terminal fragment of GFP, leading to fluorescence. For plant researchers, onion epidermal cells are an ideal experimental system for conducting the BiFC assay because of the ease in obtaining and preparing onion tissues and the direct visualization of fluorescence with minimal background fluorescence. The Helios Gene Gun (BioRad) is commonly used for bombarding plasmid DNA into onion cells. We demonstrate the use of Helios Gene Gun to introduce plasmid constructs for two interacting Arabidopsis thaliana transcription factors, SEUSS (SEU) and LEUNIG HOMOLOG (LUH)2 and the visualization of their interactions mediated by BiFC in onion epidermal cells.

Bimolecular Fluorescence Complementation BiFC Assay for Protein-Protein Interaction in Onion Cells Using the Helios Gene Gun

This article illustrates how to properly use the BioRad Helios Gene Gun to introduce plasmid DNA into onion epidermal cells and how to test for protein-protein interactions in onion cells based on the principle of Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC)

헬리 우스 진 건을 사용하여 양파 세포에서 단백질 - 단백질 상호 작용에 대한 Bimolecular 형광 Complementation (BiFC) 어세이

Investigation of gene function in diverse organisms relies on knowledge of how the gene products interact with each other in their normal cellular ...

Imaging Protein-protein Interactions in vivo

Protein-protein interactions are a hallmark of all essential cellular processes. However, many of these interactions are transient, or energetically weak, preventing their identification and analysis through traditional biochemical methods such as co-immunoprecipitation. In this regard, the genetically encodable fluorescent proteins (GFP, RFP, etc.) and their associated overlapping fluorescence spectrum have revolutionized our ability to monitor weak interactions in vivo using F&ouml;rster resonance energy transfer (FRET)1-3. Here, we detail our use of a FRET-based proximity assay for monitoring receptor-receptor interactions on the endothelial cell surface.

Imaging Protein-protein Interactions in vivo

This protocol describes how to image protein-protein interactions using a FRET-based proximity assay.

이미징 단백질 - 단백질 상호 작용 생체내에</em

Protein-protein interactions are a hallmark of all essential cellular processes. However, many of these interactions are transient, or energetically weak, ...

A Simple Method for Imaging Arabidopsis Leaves Using Perfluorodecalin as an Infiltrative Imaging Medium

The problem of acquiring high-resolution images deep into biological samples is widely acknowledged1. In air-filled tissue such as the spongy mesophyll of plant leaves or vertebrate lungs further difficulties arise from multiple transitions in refractive index between cellular components, between cells and airspaces and between the biological tissue and the rest of the optical system. Moreover, refractive index mismatches lead to attenuation of fluorophore excitation and signal emission in fluorescence microscopy. We describe here the application of the perfluorocarbon, perfluorodecalin (PFD), as an infiltrative imaging medium which optically improves laser scanning confocal microscopy (LSCM) sample imaging at depth, without resorting to damaging increases in laser power and has minimal physiological impact2. We describe the protocol for use of PFD with Arabidopsis thaliana leaf tissue, which is optically complex as a result of its structure (Figure 1). PFD has a number of attributes that make it suitable for this use3. The refractive index of PFD (1.313) is comparable with that of water (1.333) and is closer to that of cytosol (approx. 1.4) than air (1.000). In addition, PFD is readily available, non-fluorescent and is non-toxic. The low surface tension of PFD (19 dynes cm-1) is lower than that of water (72 dynes cm-1) and also below the limit (25 - 30 dyne cm-1) for stomatal penetration4, which allows it to flood the spongy mesophyll airspaces without the application of a potentially destructive vacuum or surfactant. Finally and crucially, PFD has a great capacity for dissolving CO2 and O2, which allows gas exchange to be maintained in the flooded tissue, thus minimizing the physiological impact on the sample. These properties have been used in various applications which include partial liquid breathing and lung inflation5,6, surgery7, artificial blood8, oxygenation of growth media9, and studies of ice crystal formation in plants10. Currently, it is common to mount tissue in water or aqueous buffer for live confocal imaging. We consider that the use of PFD as a mounting medium represents an improvement on existing practice and allows the simple preparation of live whole leaf samples for imaging.

A Simple Method for Imaging Arabidopsis Leaves Using Perfluorodecalin as an Infiltrative Imaging Medium

We describe the use of perfluorodecalin as an infiltrative mounting medium. This is a simple method for improving depth of imaging in Arabidopsis thaliana leaf tissue with minimal physiological impact.

이미징을위한 간단한 방법 Arabidopsis는 Infiltrative 영상 매체로 Perfluorodecalin를 사용하여 잎

The problem of acquiring high-resolution images deep into biological samples is widely acknowledged1. In air-filled tissue such as the spongy mesophyll of ...

A Liquid Phase Affinity Capture Assay Using Magnetic Beads to Study Protein-Protein Interaction: The Poliovirus-Nanobody Example

In this article, a simple, quantitative, liquid phase affinity capture assay is presented. Provided that one protein can be tagged and another protein labeled, this method can be implemented for the investigation of protein-protein interactions. It is based on one hand on the recognition of the tagged protein by cobalt coated magnetic beads and on the other hand on the interaction between the tagged protein and a second specific protein that is labeled. First, the labeled and tagged proteins are mixed and incubated at room temperature. The magnetic beads, that recognize the tag, are added and the bound fraction of labeled protein is separated from the unbound fraction using magnets. The amount of labeled protein that is captured can be determined in an indirect way by measuring the signal of the labeled protein remained in the unbound fraction. The described liquid phase affinity assay is extremely useful when conformational conversion sensitive proteins are assayed. The development and application of the assay is demonstrated for the interaction between poliovirus and poliovirus recognizing nanobodies1. Since poliovirus is sensitive to conformational conversion2 when attached to a solid surface (unpublished results), the use of ELISA is limited and a liquid phase based system should therefore be preferred. An example of a liquid phase based system often used in polioresearch3,4 is the micro protein A-immunoprecipitation test5. Even though this test has proven its applicability, it requires an Fc-structure, which is absent in the nanobodies6,7. However, as another opportunity, these interesting and stable single-domain antibodies8 can be easily engineered with different tags. The widely used (His)6-tag shows affinity for bivalent ions such as nickel or cobalt, which can on their turn be easily coated on magnetic beads. We therefore developed this simple quantitative affinity capture assay based on cobalt coated magnetic beads. Poliovirus was labeled with 35S to enable unhindered interaction with the nanobodies and to make a quantitative detection feasible. The method is easy to perform and can be established with a low cost, which is further supported by the possibility of effectively regenerating the magnetic beads.

In this article, a simple, quantitative, liquid phase affinity capture assay is presented. It is a reliable technique based on the interaction between magnetic beads and tagged proteins (e.g. nanobodies) on one hand and the affinity between the tagged protein and a second, labeled protein (e.g. poliovirus) on the other.

단백질 - 단백질 상호 작용 연구를 자성 비즈를 사용하여 액상 동질 캡처 분석 : Poliovirus-Nanobody의 예

In this article, a simple, quantitative, liquid phase affinity capture assay is presented. Provided that one protein can be tagged and another protein ...

Flow Cytometric Analysis of Bimolecular Fluorescence Complementation: A High Throughput Quantitative Method to Study Protein-protein Interaction

Among methods to study protein-protein interaction inside cells, Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) is relatively simple and sensitive. BiFC is based on the production of fluorescence using two non-fluorescent fragments of a fluorescent protein (Venus, a Yellow Fluorescent Protein variant, is used here). Non-fluorescent Venus fragments (VN and VC) are fused to two interacting proteins (in this case, AKAP-Lbc and PDE4D3), yielding fluorescence due to VN-AKAP-Lbc-VC-PDE4D3 interaction and the formation of a functional fluorescent protein inside cells.
BiFC provides information on the subcellular localization of protein complexes and the strength of protein interactions based on fluorescence intensity. However, BiFC analysis using microscopy to quantify the strength of protein-protein interaction is time-consuming and somewhat subjective due to heterogeneity in protein expression and interaction. By coupling flow cytometric analysis with BiFC methodology, the fluorescent BiFC protein-protein interaction signal can be accurately measured for a large quantity of cells in a short time. Here, we demonstrate an application of this methodology to map regions in PDE4D3 that are required for the interaction with AKAP-Lbc. This high throughput methodology can be applied to screening factors that regulate protein-protein interaction.

Flow cytometric analysis of Bimolecular Fluorescence Complementation provides a high throughput quantitative method to study protein-protein interaction. This methodology can be applied to mapping protein binding sites and for screening factors that regulate protein-protein interaction.

이분자 형광 보완의 유세포 분석 : 단백질 - 단백질 상호 작용을 연구하는 높은 처리량 정량 방법

Among methods to study protein-protein interaction inside cells, Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) is relatively simple and sensitive. BiFC ...

Identifying Protein-protein Interaction in Drosophila Adult Heads by Tandem Affinity Purification (TAP)

Genetic screens conducted using Drosophila melanogaster (fruit fly) have made numerous milestone discoveries in the advance of biological sciences. However, the use of biochemical screens aimed at extending the knowledge gained from genetic analysis was explored only recently. Here we describe a method to purify the protein complex that associates with any protein of interest from adult fly heads. This method takes advantage of the Drosophila GAL4/UAS system to express a bait protein fused with a Tandem Affinity Purification (TAP) tag in fly neurons in vivo, and then implements two rounds of purification using a TAP procedure similar to the one originally established in yeast1 to purify the interacting protein complex. At the end of this procedure, a mixture of multiple protein complexes is obtained whose molecular identities can be determined by mass spectrometry. Validation of the candidate proteins will benefit from the resource and ease of performing loss-of-function studies in flies. Similar approaches can be applied to other fly tissues. We believe that the combination of genetic manipulations and this proteomic approach in the fly model system holds tremendous potential for tackling fundamental problems in the field of neurobiology and beyond.

Identifying Protein-protein Interaction in Drosophila Adult Heads by Tandem Affinity Purification TAP

Drosophila is famous for its powerful genetic manipulation, but not for its suitability of in-depth biochemical analysis. Here we present a TAP-based procedure to identify interacting partners of any protein of interest from the fly brain. This procedure can potentially lead to new avenues of research.

단백질 - 단백질 상호 작용을 확인<em&gt; 초파리</em탠덤 선호도 정화로&gt; 성인 머리 (TAP)

Genetic screens conducted using Drosophila melanogaster (fruit fly) have made numerous milestone discoveries in the advance of biological sciences. ...

Agroinfiltration and PVX Agroinfection in Potato and Nicotiana benthamiana

Agroinfiltration and PVX agroinfection are two efficient transient expression assays for functional analysis of candidate genes in plants. The most commonly used agent for agroinfiltration is Agrobacterium tumefaciens, a pathogen of many dicot plant species. This implies that agroinfiltration can be applied to many plant species. Here, we present our protocols and expected results when applying these methods to the potato (Solanum tuberosum), its related wild tuber-bearing Solanum species (Solanum section Petota) and the model plant Nicotiana benthamiana. In addition to functional analysis of single genes, such as resistance (R) or avirulence (Avr) genes, the agroinfiltration assay is very suitable for recapitulating the R-AVR interactions associated with specific host pathogen interactions by simply delivering R and Avr transgenes into the same cell. However, some plant genotypes can raise nonspecific defense responses to Agrobacterium, as we observed for example for several potato genotypes. Compared to agroinfiltration, detection of AVR activity with PVX agroinfection is more sensitive, more high-throughput in functional screens and less sensitive to nonspecific defense responses to Agrobacterium. However, nonspecific defense to PVX can occur and there is a risk to miss responses due to virus-induced extreme resistance. Despite such limitations, in our experience, agroinfiltration and PVX agroinfection are both suitable and complementary assays that can be used simultaneously to confirm each other&#39;s results.

Agroinfiltration and PVX Agroinfection in Potato and Nicotiana benthamiana

Agroinfiltration and PVX agroinfection are routine functional assays for transient ectopic expression of genes in plants. These methods are efficient assays in effectoromics strategies (rapid resistance and avirulence gene discovery) and crucial to modern research in molecular plant pathology. They meet the demand for robust high-throughput functional analysis in plants.

감자와 니코티아나 벤타미안의 농아침투 및 PVX 농병감염

Agroinfiltration and PVX agroinfection are two efficient transient expression assays for functional analysis of candidate genes in plants. The most ...

Protein-protein Interactions Visualized by Bimolecular Fluorescence Complementation in Tobacco Protoplasts and Leaves

Many proteins interact transiently with other proteins or are integrated into multi-protein complexes to perform their biological function. Bimolecular fluorescence complementation (BiFC) is an in vivo method to monitor such interactions in plant cells. In the presented protocol the investigated candidate proteins are fused to complementary halves of fluorescent proteins and the respective constructs are introduced into plant cells via agrobacterium-mediated transformation. Subsequently, the proteins are transiently expressed in tobacco leaves and the restored fluorescent signals can be detected with a confocal laser scanning microscope in the intact cells. This allows not only visualization of the interaction itself, but also the subcellular localization of the protein complexes can be determined. For this purpose, marker genes containing a fluorescent tag can be coexpressed along with the BiFC constructs, thus visualizing cellular structures such as the endoplasmic reticulum, mitochondria, the Golgi apparatus or the plasma membrane. The fluorescent signal can be monitored either directly in epidermal leaf cells or in single protoplasts, which can be easily isolated from the transformed tobacco leaves. BiFC is ideally suited to study protein-protein interactions in their natural surroundings within the living cell. However, it has to be considered that the expression has to be driven by strong promoters and that the interaction partners are modified due to fusion of the relatively large fluorescence tags, which might interfere with the interaction mechanism. Nevertheless, BiFC is an excellent complementary approach to other commonly applied methods investigating protein-protein interactions, such as coimmunoprecipitation, in vitro pull-down assays or yeast-two-hybrid experiments.

Formation of protein complexes in vivo can be visualized by bimolecular fluorescence complementation. Interaction partners are fused to complementary parts of fluorescent tags and transiently expressed in tobacco leaves, resulting in a reconstituted fluorescent signal upon close proximity of the two proteins.

담배 원형질체 및 잎에 이분자 형광 보완에 의해 시각 단백질 - 단백질 상호 작용

Many proteins interact transiently with other proteins or are integrated into multi-protein complexes to perform their biological function. Bimolecular ...

Identifying Protein-protein Interaction Sites Using Peptide Arrays

Protein-protein interactions mediate most of the processes in the living cell and control homeostasis of the organism. Impaired protein interactions may result in disease, making protein interactions important drug targets. It is thus highly important to understand these interactions at the molecular level. Protein interactions are studied using a variety of techniques ranging from cellular and biochemical assays to quantitative biophysical assays, and these may be performed either with full-length proteins, with protein domains or with peptides. Peptides serve as excellent tools to study protein interactions since peptides can be easily synthesized and allow the focusing on specific interaction sites. Peptide arrays enable the identification of the interaction sites between two proteins as well as screening for peptides that bind the target protein for therapeutic purposes. They also allow high throughput SAR studies. For identification of binding sites, a typical peptide array usually contains partly overlapping 10-20 residues peptides derived from the full sequences of one or more partner proteins of the desired target protein. Screening the array for binding the target protein reveals the binding peptides, corresponding to the binding sites in the partner proteins, in an easy and fast method using only small amount of protein.
In this article we describe a protocol for screening peptide arrays for mapping the interaction sites between a target protein and its partners. The peptide array is designed based on the sequences of the partner proteins taking into account their secondary structures. The arrays used in this protocol were Celluspots arrays prepared by INTAVIS Bioanalytical Instruments. The array is blocked to prevent unspecific binding and then incubated with the studied protein. Detection using an antibody reveals the binding peptides corresponding to the specific interaction sites between the proteins.

Peptide array screening is a high throughput assay for identifying protein-protein interaction sites. This allows mapping multiple interactions of a target protein and can serve as a method for identifying sites for inhibitors that target a protein. Here we describe a protocol for screening and analyzing peptide arrays.

펩타이드 배열을 사용하여 단백질 - 단백질 상호 작용 사이트를 확인

Protein-protein interactions mediate most of the processes in the living cell and control homeostasis of the organism. Impaired protein interactions may ...

Luciferase 보완성 이미징 분석 결과 Nicotiana benthamiana 잎 뚜렷이 결정 단백질 단백질 상호 작용 역동성에 대 한

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