יצירת פרופיל של אפיטופים של חלבון פני השטח על חלקיקים נגיפיים על ידי אסטרטגיית Multiplex Dual-Reporter

ניתוח פרוטאומי של נגיף המעטפת גילה כי חלבונים מארחים משולבים בנגיף חדש שנוצר, ומשפיעים על שכפול, הדבקה ופתוגנזה. המחקר שלנו מתמקד ביצירת פרופיל של חלבוני פני השטח בחלקיקים נגיפיים כדי למצוא אלמנטים מרכזיים באינטראקציה בין נגיף למארח, מה שמוביל למטרות חדשות עבור אנטי-ויראלים וחיסונים. מיקרוסקופ אימונואלקטרונים הוא טכניקת ההדמיה היחידה המאפשרת הדמיה ישירה של וירוס מדכא חלבונים.

עם זאת, לכידה חיסונית של ספקטרומטריית מסה עם חרוזים מגנטיים וביומטריית זרימה מתפתחת משמשים כיום יותר כדי לאפשר פרופיל פרוטאום רחב יותר ולסנן מספר רב של חלקיקים נגיפיים. השיטה שלנו משתמשת בחרוזי Luminex מקודדים בצבע, וקריאת לייזר כפולה ללכידת חיסון. הוא מאפשר פרופיל מולטיפלקס של חלבוני פני השטח של המאכסן על נגיפים שלמים וסינון נוגדנים ותרופות אנטי-ויראליות על מספר וירוסים ואנטיגנים בו זמנית.

ספקטרומטריית מסות ופרוטאומיקה זיקה הם כלים רבי עוצמה לזיהוי חלבונים נגיפיים ומארחים על פני השטח של הנגיף. האסטרטגיה שאנו מתארים תוביל להבנה טובה יותר של תפקיד החלבונים המארחים על חלקיקי הנגיף, ותאפשר פרופיל בתפוקה גבוהה של דגימות נגועות במערכי ניסוי שונים.