Dépistage de drogues basé sur la transcriptomique rentable

La transcriptomique nous permet d’acquérir une compréhension approfondie des programmes cellulaires et de leur réaction aux changements externes. Cependant, malgré une réduction considérable des coûts de production et de séquençage des bibliothèques au cours des dernières décennies, l’application de cette technologie, à l’échelle nécessaire au criblage des médicaments, reste inabordable, ce qui entrave le grand potentiel de ces méthodes. Notre étude présente un système rentable pour le criblage de médicaments basé sur le transcriptome, combinant des cultures de perturbation miniaturisées avec une transcriptomique mini-en vrac.

Le protocole optimisé de mini-bulk fournit un signal biologique informatif à une profondeur de séquençage rentable, ce qui permet un criblage approfondi de médicaments connus et de nouvelles molécules. L’un des principaux avantages de la combinaison de la transcriptomique et du criblage non biaisé des médicaments est la possibilité d’identifier de nouvelles cibles médicamenteuses qui n’ont pas été envisagées auparavant. Les approches conventionnelles de criblage de médicaments se concentrent souvent sur des molécules ou des voies cibles établies, ce qui entrave l’identification de nouvelles cibles et peut entraîner la mise en place de médicaments ayant des effets secondaires imprévus et une efficacité limitée.