JoVE Journal

Genetics

This content is Open Access.

Séquençage de nouvelle génération d’ARN et pipeline de bioinformatique pour identifier les lignes exprimées au niveau spécifique au locus

Transcription

Ici, nous présentons une approche et des analyses bioinformatiques pour identifier l’expression LINE-1 au niveau spécifique du locus.

Chapitres dans cette vidéo

0:04

Title

0:52

Read Alignment Pipeline to Identify Expressed L1s

2:48

Manual Curation

7:48

Assess Mappability of Each L1 Loci to Factor in a Transcription Level Correction Score

8:42

Results: Identification of Full-length L1 Retroelements in the Human Prostate Tumor Cell Line, DU145

10:01

Conclusion

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