Cribado de modificación de histonas mediante cromatografía líquida, espectrometría de movilidad de iones atrapados y espectrometría de masas de tiempo de vuelo

Se propone un método que utiliza un protocolo de extracción de histonas con una eficiencia del 95%. Junto con LC-TIMS-ToF MS/MS, en poco tiempo, es posible obtener un cribado de aquellos PTM presentes en la histona. Y sobre todo, la posibilidad de separar isómeros.

La separación de péptidos isoméricos, aunque es posible utilizando solo la espectrometría de masas en tándem, suele ser difícil. Al incorporar TIMS, introducimos una dimensión adicional de separación, simplificando muchas identificaciones de isómeros posicionales. Además, la tecnología pasiva aumenta la sensibilidad de estos experimentos, mejorando aún más nuestra capacidad para analizar variaciones epigenéticas.

Con la mayor capacidad de identificar las posiciones de PTM, viene la capacidad de determinar aún más la correlación entre varios factores ambientales o biológicos y sus efectos en el epigenoma. Los métodos que mejoran y facilitan el análisis de las histonas se pueden aplicar a varias áreas de investigación, incluida la química médica y ambiental. La dinámica de la confirmación de proteínas en estados nativos o dañados se establecerá a partir de la implementación de TIMS MS/MS con HDX.

A través de LC-TIMS-ToF MS/MS y Nano LC-TIMS-ToF MS/MS, se graficarán las diferencias en PTM existentes en varias muestras biológicas.