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Análisis en tiempo real del Factor de transcripción vinculante, transcripción, traducción y rotación para mostrar los eventos globales durante la activación celular

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•

12:54 min

•

March 7th, 2018

DOI :

10.3791/56752-v

March 7th, 2018

•

Kathrin Davari*¹, Johannes Lichti*¹, Caroline C. Friedel², Elke Glasmacher¹^,³

¹Institute for Diabetes and Obesity (IDO), German Center for Diabetes Research (DZD), Helmholtz Zentrum München, ²Institute for Informatics, Ludwig-Maximilians-Universität München, ³Roche Pharma Research and Early Development, Large Molecule Research, Roche Innovation Center Penzberg

Resumen

Este protocolo describe el uso combinatorio de ChIP-seq, 4sU-seq, total RNA-seq y perfiles para las líneas celulares y células primarias del ribosoma. Permite el seguimiento de cambios en el factor de transcripción vinculante, novo de transcripción, procesamiento de RNA, rotación y traducción con el tiempo y viendo el curso general de los acontecimientos en las células activadas o cambiantes.

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ribosome profiling

reci n transcrito RNA

procesamiento de RNA

cotranscriptional empalme

tarifa de traducci n

ndice de rotaci n

atascamiento del factor de transcripci n

Capítulos en este video

0:05

Title

0:46

Profiling Recently Transcribed RNA

3:52

Profiling RNA in the Process of Translation

8:01

Profiling Transcription Factor Binding

10:35

Results: Quality Control Tests

12:05

Conclusion

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