Eine Smartphone-basierte Bildgebungsmethode für den Rasenvermeidungstest von C. elegans

Unter den vielen Verhaltensweisen, die C-elegans zeigen, ist die pathogene Rasenvermeidung die Verteidigungsstrategie des Wurms, um seine Exposition gegenüber schädlichen Krankheitserregern zu minimieren. In unserem Labor nutzen wir dieses Verhalten, um Gene zu identifizieren, die an der ordnungsgemäßen Funktion der Neuronen beteiligt sind, die dieses Verhalten vermitteln. Das Rasenvermeidungsverhalten ist ein einfacher Test, entwickelt sich jedoch über viele Stunden.

Daher ist es praktisch, wenn der Assay aufgezeichnet werden kann, um das Verhalten über lange Zeiträume zu beobachten. Wenn mehrere Assays gleichzeitig aufgezeichnet werden können, ist das noch besser. Obwohl in der Literatur viele Bildgebungslösungen beschrieben werden, können selbst einige wenige Kameras zu moderaten Preisen für Labore mit begrenzten Ressourcen unerschwinglich sein.

Einige möchten den Test auch ausprobieren, haben aber nicht vor, dies langfristig zu tun. In solchen Fällen können kurzfristige Lösungen wie dieses Protokoll helfen. Unser erstaunliches Protokoll bietet eine einfache und kostengünstige Möglichkeit, das Verhalten von Würmern aufzuzeichnen.

Wir verwenden Smartphones, um den Assay aufzuzeichnen, und verarbeiten das Video dann durch ein Python-Skript, das es für die Zählung geeignet macht.