JoVE Journal

Genetics

Sie haben vollen Zugriff auf diesen Inhalt durch

Nanyang Technological University

Bidirektionale Retrovirale Integrationsstelle PCR Methodik und quantitative Datenanalyse Workflow

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

10.7K Views

•

12:53 min

•

June 14th, 2017

DOI :

10.3791/55812-v

June 14th, 2017

•

Gajendra W. Suryawanshi*¹^,², Song Xu*³, Yiming Xie¹, Tom Chou³, Namshin Kim⁴, Irvin S. Y. Chen¹^,⁵, Sanggu Kim⁶

¹UCLA AIDS Institute, University of California at Los Angeles (UCLA), ²Department of Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics, University of California at Los Angeles (UCLA), ³Departments of Biomathematics and Mathematics, University of California at Los Angeles (UCLA), ⁴Personalized Genomic Medicine Research Center, Division of Strategic Research Groups, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, ⁵Department of Medicine, University of California at Los Angeles (UCLA), ⁶Department of Veterinary Biosciences, College of Veterinary Medicine, The Ohio State University (OSU)

Zusammenfassung

Dieses Manuskript beschreibt die experimentelle Prozedur und Softwareanalyse für einen bidirektionalen Integrationsort-Assay, der gleichzeitig stromaufwärts und nachgeschaltete Vektor-Host-Junction-DNA analysieren kann. Bidirektionale PCR-Produkte können für jede nachgeschaltete Sequenzplattform eingesetzt werden. Die resultierenden Daten sind nützlich für einen hochdurchsatzreichen, quantitativen Vergleich von integrierten DNA-Targets.

Weitere Videos entdecken

Integrationsstellen

Sequenzierung der n chsten Generation

Retrovirale Gentherapie

Zellul re Barcodierung

Kapitel in diesem Video

0:05

Title

12:09

Conclusion

10:23

Results: The IS Bidirectional Assay Improves Detection Rates and Sequence Quantification Accuracy

1:11

LTR-specific Biotin-primer Extension

2:53

Rsal and CviQI Digestion and Blunt-ending

4:12

Straptavidin Bead Binding

5:31

Linker Ligation

6:39

Pre-amplification of Both Left and Right Junction DNA

8:15

Left- and Right-junction-specific Amplifications

Ähnliche Videos

article

Merging Absolute und relative quantitative PCR-Daten zu Quantifizieren STAT3 Spleißvariante Transcripts

14.8K Views

article

Nachweis der microRNA-Expression in der peritonealen Membran von Ratten unter Verwendung der quantitativen Echtzeit-PCR

7.8K Views

article

Retroviral Scanning: Mapping MLV Integration Sites zur Definition zellspezifischer Regulierungsregionen

8.4K Views

article

Bestimmende 3'-Termini und Sequenzen der im Entstehen begriffenen einsträngige virale DNA-Moleküle während HIV-1 Reverse Transkription in infizierten Zellen

9.2K Views

article

Identification of Functionally-Relevant Lentivirus Integration Sites in an Insertional Mutagenesis Cell Library

196 Views

article

Messung von

7.4K Views

article

Erkennung von niedrigen Kopie Nummer integrierte virale DNA gebildet durch In-vitro- Hepatitis B-Infektion

18.3K Views

article

Quantifizierung von Adeno-assoziierten viralen Genomen in gereinigten Vektorproben durch digitale Tröpfchenpolymerase-Kettenreaktion

1.7K Views

article

Quantifizierung von Adeno-assoziierten viralen Genomen in gereinigten Vektorproben durch digitale Tröpfchenpolymerase-Kettenreaktion

1.7K Views

article

Quantifizierung von Adeno-assoziierten viralen Genomen in gereinigten Vektorproben durch digitale Tröpfchenpolymerase-Kettenreaktion

1.7K Views

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. Alle Rechte vorbehalten

Wir verwenden Cookies, um Ihre Erfahrung auf unserer Website zu verbessern.

Indem Sie unsere Website weiterhin nutzen oder auf „Weiter“ klicken, stimmen Sie zu, unsere Cookies zu akzeptieren.

Weitere Informationen